丹參和三七治療冠心病多靶點作用的計算研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、丹參和三七為臨床常用藥對,在國內(nèi)外,二者被廣泛地結(jié)合用于治療冠心病、心絞痛等心血管疾病。研究表明,丹參和三七具有擴張冠狀動脈血管、增加動脈血流量、激活超氧化歧化酶等藥理功效。然而,二者治療冠心病的分子機制目前尚不十分清楚。本課題采用計算機輔助藥物設(shè)計的方法來研究丹參和三七有效成分與冠心病靶點的相互作用,以期初步探討丹參和三七治療冠心病的作用機制。
  結(jié)合相關(guān)藥理實驗報道,我們一共挑選31個活性成分來組建化學(xué)成分?jǐn)?shù)據(jù)庫,其中17個

2、化合物來自丹參,14個化合物來自三七。同時,通過數(shù)據(jù)庫搜索、同源模建以及活性位點搜尋等方法,我們建立了一個冠心病相關(guān)靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫由63個活性位點已知的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)組成,其中41個靶蛋白的具有高分辨率的晶體結(jié)構(gòu)從數(shù)據(jù)庫RCSB中下載得到,另外22個靶蛋白的三維模型通過同源模建的方法獲得。
  我們利用分子對接方法來研究丹參和三七化學(xué)成分與冠心病靶點的相互作用。31個化學(xué)成分分別對接到63個靶蛋白的活性口袋中。結(jié)果顯示,有1

3、6個化學(xué)成分可作用于34個以上的靶點。其中,丹酚酸A、B、E、J、L、迷迭香酸、紫草酸、人參皂苷Rh1和槲皮素-3-O-槐糖苷9個化合物可以作用于至少45個靶點,它們可能是丹參和三七在治療冠心病中發(fā)揮作用的主要成分。同樣,冠心病相關(guān)靶點也展示出較好的網(wǎng)絡(luò)性。有36個靶標(biāo)的平均化合物數(shù)目在15個以上,它們可能是丹參和三七在治療冠心病方面主要針對的靶點。計算結(jié)果表明,丹參和三七通過不同的化學(xué)成分協(xié)同作用于冠心病相關(guān)的多個靶點,二者相互促進,

4、相互補充。它們可能通過調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝、保護血管內(nèi)皮細胞、抑制血栓形成、調(diào)節(jié)血壓多個方面來實現(xiàn)治療冠心病的目的。
  另外,計算結(jié)果預(yù)測有17個化合物對相關(guān)靶點的潛在作用屬于高活性水平,我們分析了這些化合物與其靶點間的相互作用,為將來先導(dǎo)化合物的發(fā)現(xiàn)與優(yōu)化提供了一定的基礎(chǔ)。
  本課題有關(guān)丹參和三七化學(xué)成分與冠心病靶點相互作用研究的方法以及結(jié)論,可以為將來從分子水平探討丹參和三七治療冠心病的作用機制以及發(fā)現(xiàn)新的先導(dǎo)化合物提供一定

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