杉木莖段皮層基因表達分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、利用差異顯示法(DDRT-PCR)研究杉木的2個自然變異類型(旬容0號及獨干杉)皮層(包含周皮、韌皮部、形成層及初生木質(zhì)部)基因表達差異，共獲得29個差異片段，測序后進行Blast比對分析。結(jié)果表明： 1)Blastn比對(分值＞60)分析表明共有9個片段在GeneBank中找到了相似的功能。分別與核糖體蛋白基因、信號傳導(dǎo)功能、泛素蛋白基因、抗性功能、組氨酸磷酸轉(zhuǎn)移蛋白、細胞發(fā)生功能及能量代謝相關(guān)。 2)Blastx比對

2、分析有12個序列可進行功能推測。其中7個片段和細菌、動物的功能相似，涉及膜結(jié)構(gòu)、細胞因子、代謝過程中酶的活性及一些未知蛋白。 3)還有8個差異片段在數(shù)據(jù)庫中未發(fā)現(xiàn)匹配信息。 對句容0號杉莖段皮層cDNA文庫隨機測序。分析表明有效EST序列1，119條，聚類分析和拼接后獲得354個UniGenes。Unigene比對結(jié)果表明： 1)高度相似和中度相似的序列分別為58個和70個，低度相似和無匹配序列合計達63.8％。

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