鴨黑色素相關(guān)基因多態(tài)性及其與羽色性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、羽色是禽類重要的經(jīng)濟性狀和遺傳標(biāo)記，在確定品種的親緣關(guān)系和培育優(yōu)質(zhì)的品系等方面具有重要作用。為了探索鴨羽色變異的基因調(diào)控機理，本研究以連城白鴨與白改鴨雜交后的F2代資源群體以及莆田黑鴨、恩施麻鴨、連城白鴨、白改鴨、荊江麻鴨、櫻桃谷鴨作為研究對象，以影響黑色素合成和轉(zhuǎn)運的相關(guān)基因(KIT基因、ASIP基因、ATRN基因及RAB27A基因)作為候選基因，采用5'RACE、熒光定量PCR以及單核苷酸多態(tài)性檢測等方法進行實驗，主要研究結(jié)果如下:

2、
　　1.通過對鴨KIT基因的5'RACE研究發(fā)現(xiàn)該基因mRNA存在3種不同的剪接體（剪接體1，2和3）。其中剪接體1與其他禽類KIT基因第一外顯子序列高度相似，但是與鴨KIT基因mRNA參考序列（登錄號:XM013093147.1）不同;剪接體2是鴨KIT基因第二內(nèi)含子的部分序列與第三外顯子的剪接產(chǎn)物;剪接體3是鴨KIT基因外顯子按照4-5-6-7-2-3-4順序剪接的產(chǎn)物。
　　2.通過DNA walking、熒光定量P

3、CR等實驗發(fā)現(xiàn)KIT基因是鴨基因組上的多拷貝基因，其拷貝數(shù)在不同羽色鴨群中差異不顯著，推測KIT基因的拷貝數(shù)與鴨羽色變異無關(guān)。
　　3.通過對鴨KIT基因的多態(tài)性研究及其與羽色的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):(1)鴨KIT基因第一內(nèi)含子上存在1段8 bp的缺失變異，并且該缺失在白羽及有色羽鴨群體中的分布差異不顯著(P＞0.05);(2)在該基因的第一內(nèi)含子上發(fā)現(xiàn)18個SNP位點，其中11個產(chǎn)生酶切位點的改變，酶切關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明g.912C＞G和

4、g.6578G＞A位點的3種基因型在白羽和有色羽群體中的分布差異顯著(P＜0.05)。
　　4.通過對鴨ASIP基因多態(tài)性的研究發(fā)現(xiàn):(1)鴨ASIP基因上存在5個SNP位點，但這5個位點均未產(chǎn)生酶切位點的改變;(2) ASIP基因上存在11bp的缺失變異，并且該缺失在白羽及有色羽鴨群體中的分布差異不顯著(P＞0.05);(3)通過熒光定量PCR實驗發(fā)現(xiàn)ASIP基因是鴨基因組上的多拷貝基因，其拷貝數(shù)在不同羽色鴨群間差異不顯著，推測

5、ASIP基因的拷貝數(shù)與羽色變異無關(guān)。
　　5.對連城白鴨與白改鴨雜交F2代資源群體(n=1030)的羽色分離情況進行統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)其中只有4個與親代連城白鴨黑喙白羽黑蹼性狀相同的個體，該性狀的個體約占總?cè)后w的(1/4)4，推測連城白鴨的黑喙白羽黑蹼性狀由4個位點上的基因控制。通過對鴨ATRN和RAB27A基因多態(tài)性的研究發(fā)現(xiàn):(1)鴨ATRN基因存在一段29bp的缺失變異以及一個SNP位點g.546T＞C，并且這兩種變異在連城白鴨與

6、第二世代黑喙白羽黑蹼個體中均為純合，而在白改鴨中表現(xiàn)為多態(tài);(2)鴨RAB27A基因存在一個SNP位點g.634T＞A，該位點在親代連城白鴨和第二世代黑喙白羽黑蹼個體中的基因型均為TT型，而在白改鴨中表現(xiàn)為多態(tài)，因此推測ATRN、RAB27A基因是可能調(diào)控連城白鴨黑喙白羽黑蹼性狀的兩個相關(guān)基因。
　　綜上所述:KIT基因變異可能與鴨羽色性狀相關(guān)，ASIP基因變異可能與鴨羽色性狀不相關(guān)，ATRN基因和RAB27A基因可能與連城白鴨黑