雞DGAT2基因組織表達(dá)特性及其SNP、CNV遺傳效應(yīng)分析.pdf

1、二脂酰甘油?；D(zhuǎn)移酶(diacylgycerol acyltransferase,DGAT)是一種微粒體酶，主要作用機(jī)制是使二酰甘油加上脂肪酸酰基形成三酰甘油，目前發(fā)現(xiàn)的編碼該酶的基因有DGAT1和DGAT2。有研究表明，DGAT2對(duì)脂肪代謝和生長(zhǎng)發(fā)育具有重要的作用。本課題組前期通過aCGH芯片對(duì)5個(gè)本地雞品種的全基因組CNV進(jìn)行了檢測(cè)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)：固始雞在1號(hào)染色體193951674-193966948處（CNVR）有拷貝數(shù)的缺失，而D

2、GAT2基因處于這個(gè)CNVR中。本研究的目的是探索DGAT2基因的作用及其遺傳變異（SNP和CNV）對(duì)雞生產(chǎn)性能的影響。熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)了DGAT2基因在固始雞1日齡、6周齡和16周齡的13種不同組織中的表達(dá)情況；以固始雞安卡雞F2代資源群為研究素材，篩選該基因的SNP，并與資源群的肉質(zhì)性狀、生長(zhǎng)性狀、屠體性狀等經(jīng)濟(jì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，初步揭示該SNP的變異效應(yīng)；驗(yàn)證芯片測(cè)定的DGAT2基因存在拷貝數(shù)是否真實(shí)存在，分析DGAT2基因

3、拷貝數(shù)變異與組織表達(dá)的相關(guān)性，在固始雞安卡雞F2代資源群體對(duì)DGAT2基因拷貝數(shù)進(jìn)行分型，并與資源群的經(jīng)濟(jì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，揭示拷貝數(shù)變化所引起的基因劑量效應(yīng)的影響。主要結(jié)果如下：
　　1.組織表達(dá)定量結(jié)果表明，DGAT2基因在固始雞腹脂、皮脂、下丘腦、小腸、脾臟、腎臟等組織都有不同程度的表達(dá)。1日齡時(shí)，DGAT2基因在皮脂中表達(dá)最高，其次是小腸和腎。6周齡時(shí)，DGAT2基因在腹脂中表達(dá)最高，其次是皮脂。16周齡時(shí)，DGAT2基因

4、在腹脂中表達(dá)最高，其次是脾臟和小腸。各個(gè)周齡，在心臟、肝臟、肌肉中的表達(dá)量都比較低。
　　2.DGAT2基因第7外顯子g.13955位置存在一個(gè)同義突變位點(diǎn)(C→T)，PCR擴(kuò)增產(chǎn)物被限制性酶TapⅠ酶切消化后顯示出CC、CT和TT三種不同基因型，基因型頻率分別為0.49、0.48和0.03，等位基因C和T的頻率分別為0.73和0.27。關(guān)聯(lián)分析表明：該突變位點(diǎn)對(duì)固始雞×安卡雞F2代個(gè)體初生重，2、4周齡體重、4、8周齡體尺指標(biāo)及

5、肌內(nèi)脂肪含量在不同基因型之間差異顯著(P＜0.05)，CC基因型多數(shù)性狀值顯著高于TT基因型，對(duì)其他指標(biāo)在統(tǒng)計(jì)學(xué)上無顯著影響(P＞0.05)。
　　3.DGAT2基因拷貝數(shù)結(jié)果表明：固始雞拷貝數(shù)顯著低于絲羽烏骨雞、淅川烏骨雞、盧氏綠殼蛋雞、貴妃雞、安卡雞拷貝數(shù)(P＜0.05)，其他五個(gè)品種之間差異不顯著(P＞0.05)，與芯片結(jié)果一致，說明DGAT2基因拷貝數(shù)變異是真實(shí)存在的。DGAT2基因在固始雞的拷貝數(shù)和組織表達(dá)的相關(guān)性顯示：

6、DGAT2基因拷貝數(shù)變異與組織表達(dá)呈現(xiàn)不相關(guān)（r=-0.189，P=0.451）；DGAT2基因在固始雞-安卡雞F2代資源群的拷貝數(shù)與經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果顯示：DGAT2基因拷貝數(shù)變異與固始雞安卡雞F2代資源群4周體重、體斜長(zhǎng)、胸骨長(zhǎng)、胸角和胸深以及12周胸角和胸寬等生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)顯著（P＜0.05），且2個(gè)拷貝個(gè)體性狀值占優(yōu)勢(shì)；與屠體性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，其與屠體重顯著關(guān)聯(lián)（P＜0.05），且2、3和4個(gè)拷貝個(gè)體性狀值顯著高于1個(gè)拷貝；

7、與血液生化指標(biāo)的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，其與谷草轉(zhuǎn)氨酶和乳酸脫氫酶關(guān)聯(lián)顯著（P＜0.05），且4個(gè)拷貝個(gè)體性狀值占優(yōu)勢(shì)。與肌纖維性狀的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，其
　　與雞腿肌纖維面積比關(guān)聯(lián)顯著（P＜0.05），且2和4個(gè)拷貝性狀值顯著高于1個(gè)拷貝；與肉質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)不顯著。
　　由以上試驗(yàn)結(jié)果，可得出如下結(jié)論：
　　1.雞DGAT2基因在不同階段的脂肪組織高表達(dá)，在心臟、肝臟、胸肌和腿肌低表達(dá)。在高表達(dá)的組織中，16周齡的表達(dá)量最高。

8、　　2.雞DGAT2基因g.13955位置(C→T)突變與初生重，2、4周齡體重、4、8周齡體尺指標(biāo)及肌內(nèi)脂肪含量關(guān)聯(lián)顯著（P＜0.05），CC基因型多數(shù)性狀值顯著高于TT基因型。
　　3.DGAT2基因存在拷貝數(shù)變異，其拷貝數(shù)變異與固始雞脂肪組織表達(dá)呈現(xiàn)不相關(guān)（r=-0.189，P=0.451），與固始雞安卡雞F2資源群4周齡的體重、體斜長(zhǎng)、胸骨長(zhǎng)、胸角和胸深，12周齡的胸角和胸寬，屠體重，谷草轉(zhuǎn)氨酶，乳酸脫氫酶，雞腿肌纖維面積