豬h2a.z、dazl基因分離鑒定及遺傳效應(yīng)分析

1、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文豬H2A.Z、DAZL基因分離鑒定及遺傳效應(yīng)分析姓名：張玉皓申請學(xué)位級別：碩士專業(yè)：動物遺傳育種與繁殖指導(dǎo)教師：李鳳娥20080601華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2 0 0 8 級碩士學(xué)位論文A b s t r a c tL i t t e r s i z e i s o n e o ft h ei m p o r t a n t f a c t o r s w h i c hi m p a c t t h eb e n e f

2、 i t o fp o r c i n ei n d u s t r y ．I nt h i s s t u d y , t h ec a n d i d a t eg e n ea p p r o a c hh a s b e e n e m p l o i e dt od i s c o v e r n e wm o l e c u l a rm a r k e r s a s s o c i a t e dw i t h r e

3、p r o d u c t i v e t r a i t s ．A c c o r d i n gt o p h y s i o l o g i c a l o rb i o c h e m i c a lf u n c t i o n so f g e n e s ，Q T Lm a p p i n g r e s u l t sa n d p i g —h u m a nc o m p a r a t i v em a p ， 刪

4、．Z g e n ea n d 刪Z L g e n e w e r e s e l e c t e d ．T h eo b j e c t i v eo f t h i s s t u d y W a s t oi s o l a t ea n dc h a r a c t e rt h e s ec a n d i d a t eg e n e s ，t oa n a l y z et h e e x p r e s s i o n

5、o ft h e s eg e n e si nd i f f e r e n tt i s s u e s ，t oi d e n t i f ym u t a t i o n si nt h e s eg e n e ss e q u e n c ea n d e s t a b l i s hs u i t a b l em e t h o d t od e t e c tp o l y m o r p h i s i m s ，

6、t od e t e r m i n e a s s o c i a t i o n sb e t w e e nt h ep o l y m o r p h i s m sa n dt h er e p r o d u c t i v ep e r f o r m a n c ei nf e m a lL a r g e W h i t e ．C h i n e s el e a nt y p en e wl i n eD I V a

7、 n dL a r g e W h i t e x M e i s h a n F 2r e s o u r c ep o p u l a t i o n s ．T h em a i n r e s u l t sa r e a sf o l l o w i n g ：1 ．T h e a n a l y s i sr e s u l t so f g e n e t i c e f f e c to f 刪．Z g e n e( 1

8、) A 9 3 2 b p e D N A s e q u e n c e o f p o r c i n e 刪．Z g e n e s p a n n i n gc o m p l e t e c o d i n gs e q u e n c e s ( C D S ) w a s i s o l a t e db y R T - P C R ．A 12 3 1 b p g e n o m i c s e q u e n c ee

9、n c o m p a s s i n gc o m p l e t ei n t r o n 2 ．3 a n d4 W a sa m p l i f i e d f r o mt o t a l p o r c i n e g e n o m i cD N A ．( 2 ) AP C R - 歷“l(fā) 5 I ．R F L Pa s s a yW a se s t a b l i s h e dt o d e t e c tt h e

10、4 b pd e l e t i o ni ni n t r o n2 ．( 3 )A s s o c i a t i o na n a l y s i sf o r t h e4 b p d e l e t i o nw i t hr e p r o d u c t i v et r a i t s W a sp r e f o n n e d i nn i n ei n d e p e n d e n t p o p u l a t

11、 i o n s ．S t a t i s t i c a la n a l y s i sd e m o n s t r a t e d t h a t 上b “J 5 1 p o l y m o r p h i s mw a sa s s o c i a t e dw i t l lN B A i nt h ef i r s to f D I V S O W Sa n d L a r g e W 1 1 i t eS O W S ．

12、a l la d d i t i v ee f f e c tW a s d e t e c t e d ( p < O ．0 5 o rp < O ．O 1 ) ．2 ．T h e a n a l y s i s r e s u l t s o f g e n e t i ce f f e c t o f 刪Z ￡g e n e( 1 ) A 2 8 0 5 b pc D N A s e q u e n c eo f p

13、i gD 彳Z 己g e n eW a s i s o l a t e di n c l u d i n g8 8 7 b pc o m p l e t ec o d i n gs e q u e n c e sa n d 1 9 1 7 b p3 ’U T Rs e q u e n c e s ．A ng e n o m i cs e q u e n c e o fp o r c n e 伽Z 己w h i c he n c o m

14、p a s s t h ei n t r o n so f 2 ，3 ，4 ，5 ，6 ，7 ，8 ，9w e r e a m p l i f i e df r o mp o r c i n eg e n o m i c D N A ．( 2 ) F o r 刪況g e n e ：a P C R ．M s p l ．R F L P a s s a y W a s e s t a b l i s h e d t od e t e c tt

15、 h eA ／Gm u t a t i o ni ni n t r o n7 ：a n d aP C R —T a q I ．R F L Pa s s a yW a se s t a b i l i s h e dt od e t e c t t h e A ／C m u t a t i o n i n i n t r o n 9 ．( 3 ) A s s o c i a t i o n s t u d y f o rt h e s e

16、 S N P sw i t hr e p r o d u c t i v et r a i t s w a sp r e f o r m e di nt w oi n d e p e n d e n tp o p u l a t i o n s ．S t a t i s t i c a la n a l y s i sd e m o n s t r a t e d t h a t ：T a q lp o l y m o r p h i

17、s m i sa s s o c i a t e dw i t l lN B A i nt h ef i r s tl i t t e r so f b o t l lL a r g e W h i t e S O W S ( p < n ∞) a n d L i n e D I V ( p = O ．0 6 ) ，a n a d d i t i v ee f f e c tW a sd e t e c t e d( p <

18、 O ．0 5 ) i n L a r g e W h i t e g r o u p ．( 4 ) A n r e c o m b i n a t e d v e c t o rn a m e d 刪Z 己- P G E X - k g W a sc o n s t r u c t e d a n d e x p r e s s e di nE s c h e r i c h i ac o l ie x p r e s s i o n

19、 s y s t e m ．T h e n t h ee x p r e s s e dp r o t e i nW a sd e t e c t e d i n P A G Eg e l ．t h e r e s u l to fw h i c hp r o v et h a tt h e m o l e c u l a rw e i g h t o ft h ee x p r e s s e d p r o t e i n w a

20、s i nl i n ew i t h o u r p r e d i c t i o n ．．T h er e s u l t s h o w st h a t t h e J 鼬“l(fā)5 I ．P C R ．R F L P a n dT a q I ．P C R ，R F L Pc o u l d b ec o n s i d e r e d a st h em o l e c u l a rm a r k e r s o f p o

21、 r c i n e l i t t e rs i z e ．T h e i S O l a t i o na n d i d e n t i f i c a t i o no ft h e s eg e n e sw o u l dg i v e1 1 S a m o r ep r o f o u n d ．u n d e r s t a n d i n go ft h ef u n c t i o n so f t h e s eg

22、 e n e s ，u n c o v e rt h em e c h a n i s m o fp i gl i t t e r s i z ea n dg i v et h e o r e t i c ss u p p o r t f o rm a r k e ra s s i s t a n ts e l e c t i o n ( M A S ) ．K e y w o r d s ：p i g ；r e p r o d u c