異羥肟酸類組蛋白去乙?;敢种苿┑姆肿幽M和三維定量構(gòu)效關(guān)系研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、組蛋白去乙?;福℉istone deacetylase,HDAC)是目前最具有發(fā)展前景的一類非激酶抗癌靶標。HDAC介導核小體結(jié)構(gòu)改變和調(diào)節(jié)基因表達,參與細胞周期進程和分化,并且與多種疾病如癌癥、急性髓性白血病、病毒和感染等的發(fā)生與發(fā)展有關(guān)。
   其中異羥肟酸類是研究得最多的一類小分子HDAC抑制劑。TSA和SAHA類長鏈異羥肟酸具有長鏈的異羥肟酸類HDAC抑制劑一般都含有一個異羥肟酸基團,一個由5或6個碳原子構(gòu)成的疏水性碳

2、鏈,并通過一個連接單元(connection unit,CU)與一個芳香基表面識別部分(CAP)相連接。
   在本論文中,我們除了著重綜述了異羥肟酸類HDAC及其抑制劑的研究進展之外,還詳細綜述了近些年羥肟酸類HDAC抑制劑的定量構(gòu)效關(guān)系研究(QSAR)。
   接著,我們使用Surflex-Dock對接程序?qū)AHA與HDLP以及HDAC8進行分子對接研究,并且對其結(jié)果進行分析比較,得出SAHA與HDAC8的對接結(jié)果

3、更能說明HDAC與抑制劑分子的作用形式。因此,采用HDAC8作為受體與SAHA類衍生物分子進行進一步的對接研究,并以SAHA為模版分子進行比較。
   在三維定量構(gòu)效關(guān)系研究中,我們以SAHA為代表的羥肟酸類化合物進行研究,以SAHA為先導化合物,搜集文獻中與其結(jié)構(gòu)相似的,并且有活性數(shù)據(jù)的47個化合物。在使用分子動力學模擬退火方法對47個SAHA類HDAC抑制劑分子進行構(gòu)象優(yōu)化的基礎(chǔ)之上,分別基于原子疊合和分子對接的疊合方式,采

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