西瓜花葉病毒2號基因組序列測定及HC-Pro基因的原核表達.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、  瓜類病毒病害是葫蘆科作物上的一類主要病害,病毒種類達30多種,其中以西瓜花葉病毒2號的危害最大。WMV-2發(fā)生普遍,并廣泛分布于世界各地,通常造成葫蘆科作物的大面積減產和品質的下降。本文對我國的WMV-2基因組分析研究結果如下:  以從病葉中提取WMV-2的總RNA為模板進行反轉錄合成互補DNA(cDNA),設計合成9對引物,用PCR方法擴增出WMV-2全基因組,經序列分析結果表明WMV-2全基因組序列由9657個核苷酸組成。該基

2、因組有10個功能基因,包括843bp的外殼蛋白(CP)基因、1551bp的核包含體b蛋白(NIb)基因、729bp的核包含體a病毒結合蛋白(NIa-VPg)基因、550bp的核包含體a蛋白(NIa-Pro)基因、159bp的6K2基因,1902bp的柱狀內含體蛋白(CI)基因、156bp的6K1基因、1041bp的P3基因、1371bp的輔助成份蛋白(HC-Pro)基因和1329bp的P1基因?! 〗汥NASTAR軟件分析比較,結果顯

3、示WMV-2具有與馬鈴薯Y病毒屬成員的基因組一致的結構特征,具有單一的開放讀碼框,編碼一個由3217個氨基酸組成的多聚蛋白,相對分子量為365.8kDa?! ⑽覈鳺MV-2基因組全序列與法國株系(WMV-Fr)比較,結果表明該病毒與WMV-Fr核苷酸序列和氨基酸序列同源性分別為92.4﹪和96.4﹪,各編碼蛋白區(qū)域核苷酸和氨基酸同源性分別為:P1蛋白分別為91.2﹪和90.1﹪,HC-Pro蛋白分別為94.7﹪和97.4﹪,P3蛋白

4、分別為95.34﹪和97.1﹪,CI蛋白分別為90.5﹪和95.9﹪,NIa-Vpg蛋白分別為87.5﹪和94.7﹪,NIa-Pro蛋白分別為89.7﹪和97.9﹪,NIb蛋白分別為92.8﹪和96.5﹪,CP蛋白分別為95.0﹪和98.6﹪。與馬鈴薯Y病毒屬其他成員的全序列進行比較分析,與大豆花葉病毒核苷酸和氨基酸同源性最高,分別為75.1﹪和86.0﹪。  對WMV-2的HC-Pro基因構建了原核表達載體pETWHC,并進行了原核

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