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1、四川農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文水稻TDNA插入突變體篩選以及花發(fā)育與生育期相關(guān)突變體的研究和基因克隆姓名:付崇允申請學(xué)位級別:博士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:李仕貴20070601摘要水稻是重要的糧食作物,由于其基因組較小和易于轉(zhuǎn)化等特點(diǎn),使之成為對禾谷類作物研究的模式作物。隨著水稻基因組測序的完成,后基因組(功能基因組和蛋白質(zhì)組研究)時代的到來,研究人員利用不同的方法創(chuàng)建了大量的水稻突變體,尤其近年來創(chuàng)建了大量的水稻TDNA插入突變
2、體。這類突變體由于含有特定的TDNA序列,將這些具有特定序列的TDNA作為探測基因的標(biāo)簽,為分離特定功能的基因提供了方便。本研究通過對利用粳稻品種中花ll號作為受體親本構(gòu)建的TDNA插入突變體庫進(jìn)行了篩選、鑒定和分析和相關(guān)基因的克隆,得到以下主要結(jié)果:l本研究通過對獲得的轉(zhuǎn)TDNA的中花1l再生植株以及衍生系進(jìn)行了田間性狀調(diào)查以及篩選,共獲得了1071個表型變異的穩(wěn)定株系,并對其中的450個株系利用PCR技術(shù)進(jìn)行了分子檢測,發(fā)現(xiàn)有173
3、個株系含有TDNA插入,突變表型包括抽穗期、株高、葉色、葉形、株型、有效穗、花發(fā)育以及粒型等突變體;2本研究采用TAILPCR和AdaptormediatednestedPCR(也稱為PCR步行)兩種方法擴(kuò)增得到了部分中花11突變體的TDNA插入位點(diǎn)的側(cè)翼序列;兩種方法的擴(kuò)增效率比較表明,AdaptormediatednestedPCR方法獲得側(cè)翼序列的效率較高、特異性更強(qiáng)。3本研究通過對中花11TDNA插入突變體的篩選,獲得的一份遲熟
4、突變體,表型觀察發(fā)現(xiàn)該突變體除生育期延長外,同時千粒重變小、根系變短;遺傳分析表明相關(guān)性狀受一對基因控制,且表現(xiàn)為共顯性。對AdaptormediatednestedPCR獲得的側(cè)翼序列進(jìn)行測序和序列比對,發(fā)現(xiàn)TDNA插入到該基因的推斷性的最后一個外顯子中,編碼一個推斷性的早花基因,命名為earlyflowerin93(z筘)。該基因位于第l染色體上,編碼一種推斷性單銅氧化酶前體(monocoppcroxidaseprecursor)。
5、通過基因組和已克隆相關(guān)基因的DNA序列和功能比較,認(rèn)為z掙為一個水稻控制抽穗期的新基因。在此基礎(chǔ)上,本研究已構(gòu)建了該基因的功能互補(bǔ)表達(dá)載體和2個RNA干涉相關(guān)的siRNA載體,功能驗(yàn)證的工作正在進(jìn)行中。4本研究對中花lITDNA插入過程中組培產(chǎn)生的一個水稻花發(fā)育突變體進(jìn)行了遺傳分析和細(xì)胞學(xué)觀察。該突變體表現(xiàn)為花藥短小、扭曲并且呈白色透明狀,突變性狀受一對顯性基因控制。顯微觀察發(fā)現(xiàn),該突變體的花藥壁僅有一層規(guī)則的表皮細(xì)胞層和雜亂無章的PM
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