核rDNA ITS序列在側耳屬分子分類學上的應用.pdf

1、側耳屬是一類廣為分布的且具有食(藥)用價值的木腐生真菌，種類較多，分類較為混亂。本文利用PCR產物克隆測序測定了側耳屬7個種和中國各地區(qū)栽培的11個側耳品種以及外群黑木耳的核rDNAITS(內轉錄間隔區(qū))序列，另外從GenBank獲得23個側耳種與外群亞側耳的ITS序列。運用Bioedit與Phylip軟件對所獲得的ITS序列進行分析，構建了側耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹及我國各地區(qū)側耳品種的親緣關系樹，獲得了各供試側耳之間的平均遺傳距離，研究了供試

2、側耳的分類及系統(tǒng)親緣關系?，F將實驗結果報告如下： 1.供試側耳的ITS區(qū)(含ITS1，5.8SrDNA和ITS2)序列的長度范圍為627-667bp，比對(alignment)后長度為731bp，變異位點為317個，信息位點為247個；其中，ITSl和ITS2的長度范圍分別為225-266bp和228-262bp，變異位點分別為176個和139個，信息位點分別為142個和103個；5.8SrDNA長度范圍為155-158bp，變

3、異位點為4個，信息位點為2個。 2.以亞側耳作為外群，利用MP(最大簡約法)構建的系統(tǒng)發(fā)育樹及它們之間的平均遺傳距離表明：供試材料中已定種名的30個側耳可以分為六組：第一組包括P.abieticola、P.fossulatus、刺芹側耳、白阿魏蘑、楊側耳、P.subarelatus、P.albitus、阿魏蘑、灰白側耳、哥倫比亞側耳、鳳尾菇、佛羅里達側耳和糙皮側耳。第二組含P.australis、美味側耳、肺形側耳和P.oput

4、iae。第三組含紅側耳、P.incarnatus、扇形側耳和貝蓋側耳，它們之間具有非常近的親緣關系。第四組含P.euosmus、黃白側耳和金頂側耳。第五組含囊蓋側耳、P.fusscosquamulosus、P.smithii和櫟側耳。第六組有P.javanicus與具核側耳，這兩者與其它側耳的親緣關系較遠。其中金頂側耳與黃自側耳、佛羅里達側耳與糙皮側耳、紅側耳與P.incarnates、灰白側耳與哥倫比亞側耳為同一個種兩個不同的名稱；白

5、阿魏蘑與刺芹側耳和阿魏蘑有較密切的親緣關系，但它們不是同一個種。而肺形側耳與鳳尾菇關系很遠，應屬于兩個不同的種。 3.以黑木耳作為外群，利用MP(最大簡約法)構建的親緣關系樹及它們之間的平均遺傳距離表明：我國各地區(qū)主要栽培的側耳品種按親緣關系可分為五大組：第一組包括鳳尾菇、灰白側耳、佛羅里達側耳、糙皮側耳、緣刺側耳、平802、日本秀珍和姬菇。其中糙皮側耳與佛羅里達側耳為同一個種，日本秀珍、緣刺側耳及姬菇都為哥倫比亞側耳下的栽培品

6、種。第二組含杏孢菇、香側耳、白阿魏蘑、刺芹側耳、阿魏蘑，其中杏孢菇即刺芹側耳與香側耳具有非常近的親緣關系，白阿魏蘑與白靈菇為同一個種兩個不同的名稱，而且杏孢菇、白靈菇與阿魏蘑之間有比較密切的親緣關系。第三組含平963-1、楊側耳。平963-1與楊側耳親緣關系較近，但不能確定它是否屬于楊側耳。第四組含平側5、平8804、小白平菇、美味側耳、肺形側耳，其中平側5和小白平菇是美味側耳種下的栽培種。第五組含榆黃蘑、雞汁菌、黃白側耳，這三者之間具