基于nLSU rDNA和ITS序列對側耳屬系統(tǒng)發(fā)育關系的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、側耳屬(Pleurotus)真菌中許多種類與人類關系密切,且具有重要的經濟價值。側耳屬真菌種類繁多,起源和進化關系復雜,分類較為混亂,其系統(tǒng)發(fā)育關系一直存在爭議。隨著現(xiàn)代生命科學技術的飛速發(fā)展,新方法和新技術不斷涌現(xiàn),并逐步應用到側耳屬的系統(tǒng)發(fā)育和分類研究中。本文以傳統(tǒng)的形態(tài)分類鑒定為基礎,采用PCR產物克隆測序和直接測序獲得側耳屬27個種或亞種48個菌株的核糖體DNA大亞基(LSUrDNA)和ITS序列,以亞側耳(H.serotina

2、)、雙孢蘑菇(A.bisporus)和香菇(L.edodes)為外群,運用PHYLIP和MAGA軟件中的距離法和最大簡約法,分別構建了側耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹,以期進一步探討其系統(tǒng)演化關系,為生產利用和科學研究提供參考依據。 根據菌絲體形態(tài)可將48株供試側耳分為5大類:第一類僅包括櫟側耳(P.dryinus);第二類包括P.australis、鮑魚菇(P.abalones)、蓋囊側耳(P.cystidiosus)、P.cystidios

3、usvar.formosensis、P.smithii5種側耳;第三類包括紅側耳(P.djamor)和桃紅側耳(P.salmoneostramineus);第四類為P.lampas;第五類包括其它所有的供試菌株。子實體形態(tài)特征觀察表明,除P.abieticola、P.euosmus、P.incarnates、P.lampas、P.rattenburyi、哥倫比亞側耳(P.columbinus)、具核側耳(P.tuber-regium)等

4、種類的菌株未出菇而不能進行形態(tài)觀察之外,其它供試菌株均能鑒定到種。 基于LSUrDNA序列分析構建的側耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹表明:側耳屬菌株被分為6個主要分支。第I分支僅包括P.rattenburyi;第II分支包括P.djamor、P.salmoneostramineus、扇形側耳(P.flabellatus)、貝蓋側耳(P.calyptratus)、金頂側耳(P.citrinopileatus)和P.euosmus;第III分支主要

5、包括P.dryinus和P.tuber-regium;第Ⅳ分支包括Coremiopleurotus組的成員P.abalomus、P.smithii,P.cystidiosus及其變種;第V分支只有P.australis;第VI分支包括刺芹側耳(P.eryngii)種族群、糙皮側耳(P.ostreatus)復合群、肺形側耳(P.pulmonarius)和P.abieticola。糙皮側耳復合群包括P.ostreatus、灰白側耳(P.sp

6、odoleuces)、P.columbinus、美味側耳(P.spodoleucus)和佛羅里達側耳(P.floridanus)組成。系統(tǒng)發(fā)育樹還表明,Coremiopleurotus組的成員P.australis、P.abalomus、P.cystidiosus、P.smithii可能是一個多系起源的類群。 基于ITS序列分析構建的側耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹表明,該系統(tǒng)樹自根部逐漸延伸出6個主要分支,分別代表側耳屬6個主要類群。第I分支

7、包括P.rattenburyi和Hserotina;第II分支僅為P.tuber-regium:第III分支包括P.dryinus、P.citrinopileatus和P.euosmus:第IV分支為Coremiopleurotus組的成員P.australis、P.abalomus、P.smithii、P.cystidiosus及其變種:第V分支為P.djamor、P.salmoneostramineus、P.flabellatus、

8、P.incarnates和P.calyptratus:第VI分支包括P.pulmonarius、P.arbieticola、P.eryngii、白靈側耳(P.nebrodensis)、P.ostreatus、P.floridanus、P.columbinus、P.spodoleucus、黃白側耳(P.conucopiae)、P.spodoleucus。在這些類群中,同一側耳種的不同菌株也能很好的聚在一起。在第VI分支中,側耳屬菌株又被明

9、顯的分為5個類群。即:A類群為P.pulmonarius;B類群為P.arbieHcola;C類群為P.eryngii種族群;D類群為P.nebrodensis;E類群為P.ostreatus復合群。相比而言,ITS序列在種間和種內分類鑒定中顯示出明顯的優(yōu)勢。該系統(tǒng)樹還表明Coremiopleurotus組的成員P.australis、P.abalomus、P.cystidiosus、P.smithii可能是單系起源的類群。據此推測,P

10、.fuscusval.ferulae可能就是阿魏菇(P.ferulae)。 基于LSU序列和ITS序列構建的側耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹均表明,側耳屬內單系菌絲系統(tǒng)和二系菌絲系統(tǒng)菌株可能是多系起源的。P.calyptratus與P.djamor、P.salmoneostramineus、P.flabellatus關系密切。P.citrinopileatus與P.conucopiae為不同的種。P.lampas與側耳屬其它成員的親緣關系極遠,

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