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1、南京農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文產(chǎn)酶溶桿菌生防相關(guān)基因的克隆、功能分析及工程菌構(gòu)建姓名:錢(qián)國(guó)良申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:博士專(zhuān)業(yè):植物病理學(xué)指導(dǎo)教師:劉鳳權(quán)20091201產(chǎn)酶溶桿菌生防相關(guān)基因的克隆、功能分析及工程菌構(gòu)建名為OHllH和OHllB。在LA平板上,野生型OHll產(chǎn)生黃色素,菌落為黃色。色素突變株OHllH可以產(chǎn)生可溶性的黑色素,但其菌落仍為黃色;OHllB茵落形態(tài)為白色,缺失了黃色素的合成。通過(guò)任意PCR和亞克隆技術(shù),鑒定了轉(zhuǎn)座子在OHll
2、H和OHllB中的插入位點(diǎn)分別為hmgA基因和acp基因。hmgA基因編碼尿黑酸1,2加氧化酶,參與酪氨酸的代謝。而acp基因編碼3羰基(?;d體蛋白)合成酶I,與脂肪酸生物合成(FAS)相關(guān)。在前期以幽謝基因作為報(bào)告基因篩選自殺載體的基礎(chǔ)上,本研究再次以hmgA為報(bào)告基因,驗(yàn)證不同類(lèi)型的自身載體在OHll中完成基因定向敲除的可行性,并再次確認(rèn)在參試的自殺載體中,只有pEXl8GM才能完成靶標(biāo)基因的定向缺失敲除,與前期篩選結(jié)果一致。通過(guò)
3、同源重組技術(shù),分別構(gòu)建了hmgA和acp的定向敲除突變株,并明確hmgA的突變改變了OHll的細(xì)胞形態(tài),使細(xì)胞從棍棒狀變?yōu)闄E圓狀,但不改變茵落形態(tài);提高了OHll生物膜形成能力、在水稻葉片上的定殖能力及對(duì)水稻紋枯病的防效,但不改變OHII胞外多糖形成能力、4種胞外酶的產(chǎn)生能力和平板拮抗活性。明確了acp的突變不改變OHll的細(xì)胞形狀,但使細(xì)胞周?chē)岸嗵恰鳖?lèi)物質(zhì)增加,降低了OHll生物膜形成能力,在水稻葉片上的定殖能力及對(duì)水稻紋枯病的防效
4、,同樣不改變OHll胞外多糖形成能力、4種胞外酶的產(chǎn)生能力和平板拮抗活性。此外,還初步明確了可溶性黑色素和茵體自身的黃色素可能與細(xì)茵抵御紫外光損傷無(wú)關(guān)。結(jié)合表型篩選和驗(yàn)證,從OHll的突變株文庫(kù)中篩選到5株胞外多糖(exopolysacchide,EPS)缺失突變株,分別命名為MEPSlMEPS5。在LAS培養(yǎng)基上,野生型OHll菌落黃色、飽滿(mǎn)、光滑,而EPS缺失突變株茵落干燥、皺縮,但菌落仍為黃色。通過(guò)任意PCR技術(shù)(arbitrar
5、yPCR),快速鑒定了轉(zhuǎn)座子在MESlMES5中的插入位點(diǎn)分別為別是tonB基因、透性酶(permease)編碼基因、IV分泌系統(tǒng)中Pilin蛋白編碼基因,以及未知蛋白編碼基因,表明眾多基因參與了EPS的合成。在任意PCR的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步通過(guò)亞克隆技術(shù)(subcloning),克隆了tonB的完整基因。通過(guò)同源重組技術(shù),構(gòu)建了tonB定向缺失突變株,并明確tonB的突變降低了OHll的滑行能力,改變了OHll的茵落形態(tài),但不改變菌體細(xì)胞
6、形態(tài);降低了OHll生物膜形成能力、在水稻葉片上的定殖能力及對(duì)水稻紋枯病的防效。初步明確了EPS可能與產(chǎn)酶溶桿菌抵御紫外光損傷相關(guān)。利用大腸桿菌中的組成型強(qiáng)啟動(dòng)子P切實(shí)現(xiàn)了外源基因即AHL類(lèi)信號(hào)分子降解基因aiiA在產(chǎn)酶溶桿菌OHll中的重組表達(dá),構(gòu)建了抗生素標(biāo)記的工程菌株OHllA。菌株OHllA能顯著降解不同植物病原細(xì)菌產(chǎn)生的AHL類(lèi)信號(hào)分子。在離體生防試驗(yàn)中,OHllA能大幅度降低軟腐病菌對(duì)大白菜的致病性,但不抑制軟腐病菌在寄主組
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