36116.tcp轉(zhuǎn)錄因子和真核rdrp基因家族的分子進(jìn)化學(xué)研究_第1頁(yè)
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1、上海大學(xué)碩士學(xué)位論文TCP轉(zhuǎn)錄因子和真核RdRP基因家族的分子進(jìn)化學(xué)研究姓名：姚譞申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專(zhuān)業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師：王健張大兵20080501上海大學(xué)碩士學(xué)位論文ABSTRACTBioinformaticswaswidelyusedindifferentfieldsofbiologicalresearchesInthispaperweapplieditinthestudiesonthemolecularevoluti

2、onofTCPtranscriptionfactorgenefamilyandeukaryoticRdRPgenefamilySeveralTCPgeneshavebeenreportedtoplayimportantrolesinplantdevelopment，theTCPhomologsencodesaplantspecifiicfamilyofputativetranscriptionfactorsTounderstandthe

3、evolutionaryrelationshipofTCPgenesofArabidopsisthalianaandOryzasativa三(hereaftercalledrice)，weidentified23and22TCPgenesinArabidopsisandricegenomedatabases，andtheirphylogeneticanalysesindicatethattheyformthreewellsupporte

4、dclades，whicharedefinedassubfamiliesWealsoanalysedtheaminoacidcontributionintheTCPdomain，showingthatitdisplayedallatypicalbHLHstructure，implyingthattheseconservedresidueswereimportantforthefunctionsofTCPproteinsBesidesTC

5、Pdomain，othermotifswerealsoincludedinsomeTCPproteinsThegenomedistributionoftheTCPgenesstronglysupportsthehypothesisthatgenome—wideandtandemduplicationcontributedtotheexpansionoftheTCPgenefamilyTheexpressionpatternsofTCPg

6、enesinArabidopsisandriceindicatedthattheymightplaydifferentrolesinthemolecularregulationofplantdevelopmentEukaryoticRNAdependentRNApolymerase(RdRP)wasshowedtoheimportantindiverseRNAsilencingmechanisms，whichwereprovedtobe

7、importantindevelopmentalregulation，maintenanceofgenomeintegritydefenseagainstforeignnucleicacidandSOon，anditshomologsencodeaeukaryoticgenefamilyInthisarticle，weidentifiedthegenefamilymembersinwiderangeofeukaryotes，fromea

8、rlybranchingprotiststomulticellularorganisms，includingplants，animalsandfungiAnimalRdRPswerenotaswidelydistributedasthatinplantsandfungi，anditcouldnotbedetectedinsomeanimals，eventhoughRNAinterferenceOccursintheseorganisms

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