高通量測序和降解組分析白花泡桐鹽脅迫相關microRNAs.pdf

1、鹽脅迫是影響樹木生長和木材產量的主要非生物脅迫之一。越來越多的研究表明MicroRNAs(miRNAs)在木本植物的生長發(fā)育、新陳代謝和脅迫響應中發(fā)揮重要的作用。為了鑒定分析白花泡桐中與鹽脅迫相關的miRNAs，本研究構建了二倍體白花泡桐對照組(PF2)和鹽處理組(PF2-S4)兩個小RNAs文庫。采用高通量測序技術總共鑒定出來了33個已知miRNA和80個新miRNA，在這些miRNAs中分別有27個（3個已知miRNA和24個新mi

2、RNA）差異顯著表達和有45個（13個已知miRNA和32個新miRNA）差異極顯著表達。降解組測序在PF2降解組文庫中鑒定出來了34個miRNA調控的61個靶基因;在PF2-S4降解組文庫中鑒定出來了35個miRNA調控的64個靶基因。隨后用GO功能注釋對靶基因進行功能分類，其中56個靶基因與分子功能有關，52個靶基因與細胞組成有關，52個靶基因與生物學過程有關。最后采用實時熒光定量PCR驗證了6個差異表達的miRNAs和8個靶基因，

3、進一步驗證測序的準確性。
　　在本研究中，我們預測到的一些白花泡桐miRNA的靶基因。如pfo-miR5021 a/5021b調控的靶基因與Dof鋅指蛋白和F-box蛋白相關;pfo-miR157a/157b調控的靶基因與E3泛素蛋白連接酶RGLG2相關;pfo-mir843調控的靶基因與THO亞族復合體相關;pfo-mir580調控的靶基因與組蛋白H2/H2A相關。這些miRNAs及其靶基因很可能與白花泡桐的抗鹽脅迫相關。