青海湖裸鯉AFLP指紋圖譜的構(gòu)建以及與生長相關(guān)SNP位點的篩選.pdf

1、青海湖裸鯉是我國的瀕危物種之一，在保護和恢復野生青海湖裸鯉資源的工作中親本選育是重中之重。本研究中，通過多元回歸分析、通徑分析及相關(guān)分析的方法對青海湖裸鯉的體質(zhì)量和相關(guān)形態(tài)性狀進行了分析；其次，采用AFLP標記的方法對不同支流中的青海湖裸鯉群體的遺傳多樣性進行研究；最后，采用序列比對的方法對青海湖裸鯉的GH基因進行SNP位點的確定，并與青海湖裸鯉的體重與形態(tài)性狀進行關(guān)聯(lián)分析，篩選與生長相關(guān)的SNP位點。具體研究內(nèi)容及結(jié)果如下：
　

2、　1、為確定體質(zhì)量與形態(tài)性狀之間的關(guān)系，本研究通過對人工養(yǎng)殖的200尾2+齡青海湖裸鯉為研究對象，測量了全長、體長、頭高、眼間距、體高、體寬、尾柄長、肛前距和臀鰭基長等9項形態(tài)學指標和體質(zhì)量，利用通徑分析、多元回歸分析和相關(guān)分析的統(tǒng)計分析方法對青海湖裸鯉的形態(tài)學指標和體質(zhì)量之間的關(guān)系，結(jié)果表明：青海湖裸鯉測量形態(tài)性狀與體質(zhì)量間的相關(guān)系數(shù)均達到極顯著水平（p＜0.01）；通徑分析結(jié)果顯示體長對體質(zhì)量的直接影響最大，其次為體高、臀鰭基長；建

3、立青海湖裸鯉的各形態(tài)性狀與體質(zhì)量的最優(yōu)多元回歸方程為：Y=3.502 X2+11.01 X5+4.188 X9-48.088，回歸常數(shù)檢驗表明青海湖裸鯉體長、體高、臀鰭基長對體質(zhì)量的回歸系數(shù)均達到顯著水平（P＜0.05），復相關(guān)分析表明體長、體高、臀鰭基長對體質(zhì)量的相關(guān)指數(shù)均≥0.85，擬合優(yōu)度較高。育種目標性狀的選擇策略應選體長、體高、臀鰭基長。
　　2、為揭示青海湖不同支流中青海湖裸鯉（Gymnocypris przewals

4、kii）群體間的遺傳種質(zhì)差異及遺傳多樣性，采用AFLP標記的方法對采自于不同支流中的群體進行了擴增片段長度多態(tài)性分析。應用10對多態(tài)性引物在6個青海湖裸鯉群體中共擴增位點348個，其中多態(tài)性位點184個，多態(tài)性條帶占總擴增條帶的比例為52.9％；篩選得到79個特異位點，構(gòu)建了AFLP指紋圖譜，根據(jù)譜帶特征可以將不同支流中的青海湖裸鯉準確區(qū)分。遺傳聚類分析對比結(jié)果表明：當遺傳相似系數(shù)為0.87時，將六條河流的裸鯉歸為為四支，沙柳河、甘子河

5、、黑馬河各歸一支，哈爾蓋河、泉吉河、布哈河為同一支。
　　3、硬骨魚類的生長是由GH/IGF-I生長軸控制的，魚類生長激素（Growth hormone, GH）處于核心地位，為篩選青海湖裸鯉與生長相關(guān)的SNP位點，本研究通過對200尾青海湖裸鯉個體的GH基因部分片段進行直接測序，進而分析比較，并與青海湖裸鯉生長性狀之間進行關(guān)聯(lián)分析，初步篩查得到了3個與生長性狀相關(guān)的SNP位點。對于位點SNP68，基因型CC的個體在體高和體重上比