青海湖裸鯉AFLP指紋圖譜的構(gòu)建以及與生長相關(guān)SNP位點(diǎn)的篩選.pdf

1、青海湖裸鯉是我國的瀕危物種之一，在保護(hù)和恢復(fù)野生青海湖裸鯉資源的工作中親本選育是重中之重。本研究中，通過多元回歸分析、通徑分析及相關(guān)分析的方法對(duì)青海湖裸鯉的體質(zhì)量和相關(guān)形態(tài)性狀進(jìn)行了分析；其次，采用AFLP標(biāo)記的方法對(duì)不同支流中的青海湖裸鯉群體的遺傳多樣性進(jìn)行研究；最后，采用序列比對(duì)的方法對(duì)青海湖裸鯉的GH基因進(jìn)行SNP位點(diǎn)的確定，并與青海湖裸鯉的體重與形態(tài)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，篩選與生長相關(guān)的SNP位點(diǎn)。具體研究內(nèi)容及結(jié)果如下：
　

2、　1、為確定體質(zhì)量與形態(tài)性狀之間的關(guān)系，本研究通過對(duì)人工養(yǎng)殖的200尾2+齡青海湖裸鯉為研究對(duì)象，測量了全長、體長、頭高、眼間距、體高、體寬、尾柄長、肛前距和臀鰭基長等9項(xiàng)形態(tài)學(xué)指標(biāo)和體質(zhì)量，利用通徑分析、多元回歸分析和相關(guān)分析的統(tǒng)計(jì)分析方法對(duì)青海湖裸鯉的形態(tài)學(xué)指標(biāo)和體質(zhì)量之間的關(guān)系，結(jié)果表明：青海湖裸鯉測量形態(tài)性狀與體質(zhì)量間的相關(guān)系數(shù)均達(dá)到極顯著水平（p＜0.01）；通徑分析結(jié)果顯示體長對(duì)體質(zhì)量的直接影響最大，其次為體高、臀鰭基長；建

3、立青海湖裸鯉的各形態(tài)性狀與體質(zhì)量的最優(yōu)多元回歸方程為：Y=3.502 X2+11.01 X5+4.188 X9-48.088，回歸常數(shù)檢驗(yàn)表明青海湖裸鯉體長、體高、臀鰭基長對(duì)體質(zhì)量的回歸系數(shù)均達(dá)到顯著水平（P＜0.05），復(fù)相關(guān)分析表明體長、體高、臀鰭基長對(duì)體質(zhì)量的相關(guān)指數(shù)均≥0.85，擬合優(yōu)度較高。育種目標(biāo)性狀的選擇策略應(yīng)選體長、體高、臀鰭基長。
　　2、為揭示青海湖不同支流中青海湖裸鯉（Gymnocypris przewals

4、kii）群體間的遺傳種質(zhì)差異及遺傳多樣性，采用AFLP標(biāo)記的方法對(duì)采自于不同支流中的群體進(jìn)行了擴(kuò)增片段長度多態(tài)性分析。應(yīng)用10對(duì)多態(tài)性引物在6個(gè)青海湖裸鯉群體中共擴(kuò)增位點(diǎn)348個(gè)，其中多態(tài)性位點(diǎn)184個(gè)，多態(tài)性條帶占總擴(kuò)增條帶的比例為52.9％；篩選得到79個(gè)特異位點(diǎn)，構(gòu)建了AFLP指紋圖譜，根據(jù)譜帶特征可以將不同支流中的青海湖裸鯉準(zhǔn)確區(qū)分。遺傳聚類分析對(duì)比結(jié)果表明：當(dāng)遺傳相似系數(shù)為0.87時(shí)，將六條河流的裸鯉歸為為四支，沙柳河、甘子河

5、、黑馬河各歸一支，哈爾蓋河、泉吉河、布哈河為同一支。
　　3、硬骨魚類的生長是由GH/IGF-I生長軸控制的，魚類生長激素（Growth hormone, GH）處于核心地位，為篩選青海湖裸鯉與生長相關(guān)的SNP位點(diǎn)，本研究通過對(duì)200尾青海湖裸鯉個(gè)體的GH基因部分片段進(jìn)行直接測序，進(jìn)而分析比較，并與青海湖裸鯉生長性狀之間進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，初步篩查得到了3個(gè)與生長性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn)。對(duì)于位點(diǎn)SNP68，基因型CC的個(gè)體在體高和體重上比