大型真菌黑松露EST-SSR信息分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、黑松露(Tubermelanosporum)是一種生長于地下的稀有珍稀野生食用真菌，具有極高的營養(yǎng)保健價(jià)值。因價(jià)格昂貴，被稱為餐桌上的“黑色鉆石”。我國云南等地有少量分布，但其野生種群遺傳多樣性等相關(guān)研究尚屬空白。到目前為止，通過應(yīng)用EST-SSR分子標(biāo)記研究動(dòng)植物遺傳多樣性已經(jīng)相當(dāng)普遍，但在真菌中，最近只有關(guān)于香菇的報(bào)道，其他品種卻鮮有報(bào)道。本研究首先對國外著名的SSR搜索軟件進(jìn)行本地化，驗(yàn)證有效后利用該軟件并結(jié)合生物信息學(xué)方法對NC

2、BI網(wǎng)上公開的7254條黑松露EST進(jìn)行了搜索，共檢索出276個(gè)SSR，平均布距離為1.2kb，檢出率為3，80％，包括167種重復(fù)基元。其中三核苷酸和六核苷酸重復(fù)單元出現(xiàn)的頻率基本相近，占總SSR的近96.4％，居于所有EST—SSR的主導(dǎo)地位;其它重復(fù)類型所占比例均不足0.6％。CAG和CAGCAA是三、六核苷酸中出現(xiàn)次數(shù)最多的類型，分別占三、六核苷酸重復(fù)類型的21.0％和3.6％。研究結(jié)果對今后黑松露種質(zhì)資源鑒定，遺傳圖譜構(gòu)建、比

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