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文檔簡介
1、米象(Sitophilusoryzae),是世界經(jīng)濟最重要的貯藏害蟲之一,隸屬于鞘翅目象蟲科,對糧食貯藏造成了嚴重的損害。米象的防治目前主要是磷化氫熏蒸,磷化氫熏蒸劑其具有殺蟲毒力高、滲透作用強等特點。但是現(xiàn)在我國多個省、市的糧庫害蟲米象產(chǎn)生了磷化氫抗性,因此開發(fā)米象的生物技術(shù)防治及明確米象的磷化氫抗性機制就非常迫切。本文采用Solexa高通量測序技術(shù),對米象的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進行了研究和分析,明確了抗性相關(guān)的基因片段序列,研究了磷化氫熏蒸后
2、米象谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶相關(guān)基因和抗性基因的表達變化以及高溫刺激后米象熱激蛋白家族相關(guān)基因的表達變化。本研究結(jié)果首次明確了米象的遺傳基因信息,為進一步開展米象全基因組測序、明確米象抗性分子機制以及米象的生物防治建立了基礎(chǔ)。
運用Solexa高通量測序技術(shù),米象轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫共獲得21,583,796條reads數(shù)據(jù),共包含1,618,784,700個核苷酸序列信息,得到67,264個Contigs片段,經(jīng)過拼接共獲得29,093條U
3、nigenes,經(jīng)NCBI數(shù)據(jù)庫BLAST比對,共有16,734(57.5%)與已知的蛋白質(zhì)具有相似性。轉(zhuǎn)錄組中Unigenes的KEGG功能注釋分析結(jié)果表明,參與泛素系統(tǒng)通路的相關(guān)基因是778條,占9.31%;與肽酶相關(guān)的基因是512條,占6.13%;與轉(zhuǎn)錄因子相關(guān)的基因是489條,占5.85%;最少的為參與萬古霉素類抗生素的生物合成、聚酮糖單位合成、1,1,1-三氯-2,2-雙(4-氯苯基)乙烷(DDT)的降解、芴降解這4種途徑相關(guān)
4、基因,都僅只有1條。
對米象的一些功能基因家族進行分析,包括7個具有代表性的基因家族。編碼谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶(GST)家族基因的Unigene序列為16個,分別編碼GST的Delta、Sigma、Theta、Epsilon和Zeta亞基。編碼細胞色素P450家族基因的Unigene為105個,分別編碼16個P450家族的成員。編碼熱激蛋白(HSP)、保幼激素結(jié)合蛋白(JHBP)、幾丁質(zhì)酶(CHI)、氣味結(jié)合蛋白(OBP)和神經(jīng)肽
5、(Neuropeptide)的Unigene分別為33、24、18、23、34個。我們進一步從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中鑒定出一些米象抗性靶標相關(guān)的10個特異性基因序列,包括乙酰膽堿酯酶(AChE),氨基丁酸(GABA)受體蛋白,煙堿型乙酰膽堿受體(nAChR)-α3、α6、α9、α10亞型,電壓門控鈣通道蛋白β亞型和電壓門控鈉離子通道蛋白等。
熒光定量PCR結(jié)果顯示,磷化氫熏蒸后,米象的谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶相關(guān)基因的表達量總體呈上升趨勢,但是
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