德國鏡鯉與黑龍江野鯉雜交組合的親子鑒定及鯉魚免疫功能基因SNP位點(diǎn)研究.pdf

1、一、德國鏡鯉與黑龍江野鯉雜交組合的親子鑒定
　　利用微衛(wèi)星多態(tài)性進(jìn)行魚類親子鑒定,在魚類選育中具有重要意義。本研究采用8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)黑龍江野鯉♀×德國鏡鯉♂(正交組合),及德國鏡鯉♀×黑龍江野鯉♂(反交組合)進(jìn)行親子鑒定。結(jié)果顯示:(1)正交組中父母本和子代觀測(cè)雜合度分別為0.6071、0.7143和0.6818,多態(tài)信息含量依次為0.4421、0.2813和0.5535;反交組中父母本和子代觀測(cè)雜合度分別為0.7083、0.5

2、386和0.7438,多態(tài)信息含量依次為0.6735、0.3759和0.6241,表明8個(gè)位點(diǎn)具有較高的多態(tài)性。(2)正交組中,8個(gè)位點(diǎn)累計(jì)排除率為99.92％,親本與子代的配對(duì)率98.00%(置信度為95%);反交組中,8個(gè)位點(diǎn)累計(jì)排除率為99.99%,親本與子代的配對(duì)率99.00%(置信度為95%)。(3)關(guān)于使用微衛(wèi)星標(biāo)記數(shù)與鑒定率的探討,對(duì)3、4、5、6、7、8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記時(shí)的累計(jì)排除率和親子配對(duì)率比較,結(jié)果表明,正反交組分別利

3、用6和8個(gè)多態(tài)性良好的引物就能正確鑒定。
　　二、鯉魚免疫功能基因 SNP位點(diǎn)的研究
　　研究表明,11個(gè)鯉魚免疫功能基因中有4個(gè)具有SNP。為此,做了進(jìn)一步的SNP多態(tài)性研究。
　　1.11個(gè)基因 SSCP結(jié)果
　　對(duì) TLR2、TLR3a、TLR3b、TLR7a、TLR7b、TLR9、I型 IFN、TRAF6、IL-1β、MyD88a、MyD88b11個(gè)基因進(jìn)行8個(gè)鯉魚群體292個(gè)個(gè)體 SSCP檢測(cè)。結(jié)果 T

4、LR2、TLR3a、TLR3b、TLR7a、TLR7b、I型 IFN、TRAF6無 SNP位點(diǎn)。IL-1β、TLR9、MyD88a、MyD88b基因多態(tài)性較高。
　　2. IL-1β基因
　　IL-1β基因在8個(gè)群體292個(gè)個(gè)體中共檢測(cè)出13個(gè)變異位點(diǎn),占整個(gè)片段長(zhǎng)度的2.41%,其中3個(gè)為非同義突變。用NJ法進(jìn)行8個(gè)群體的個(gè)體聚類,得出的結(jié)論是松浦鏡鯉、松荷鯉及黑龍江野鯉大部分個(gè)體首先聚在一起,其次與松浦鯉,德國鏡鯉成活組

5、及德國鏡鯉死亡組聚在一起,最后再與易捕鯉、大頭鯉聚在一起。根據(jù)遺傳距離的進(jìn)行的種群聚類分析的結(jié)果與個(gè)體聚類分析的結(jié)果大致相同。
　　3. TLR9基因
　　TLR9基因在292個(gè)個(gè)體中共檢測(cè)出37個(gè)變異位點(diǎn),其中20個(gè)變異位點(diǎn)引起氨基酸的變化。c.988C>T、c.1237T>C、c.1700T>A、c.1770A>G、c.2278T>C、c.2307T>C、c.2377A>G、c.2547A>T、c.2580T>A、c.2