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文檔簡介
1、棉花纖維的長度是評價棉花纖維內(nèi)在品質(zhì)的一個很重要的指標(biāo),同時單粒籽棉的棉花纖維數(shù)量直接影響棉花皮棉產(chǎn)量。
研究表明,植物表皮細(xì)胞的發(fā)育受多個基因調(diào)控,表皮細(xì)胞的發(fā)育在不同植物中具有相似的基因調(diào)控模式。棉花纖維是胚珠外珠被表皮細(xì)胞發(fā)育延伸而成的表皮毛,棉花纖維細(xì)胞的發(fā)育與擬南芥表皮毛發(fā)育模式相似。擬南芥中存在GLABROUS1(GL1)、GLABRA2(GL2)、GLABRA3(GL3)、TRANSPARENT TESTA
2、GLABRA1(TTG1)、TRANSPARENT TESTA GLABRA2(TTG2)等基因促進(jìn)擬南芥表皮毛的發(fā)育,同時又存在TRIPTYCHON(TRY)和CAPRICE(CPC)基因抑制擬南芥表皮毛的發(fā)育。前人研究報道,棉花中也存在TTG1、GL1、GL2等同源基因促進(jìn)棉纖維的發(fā)育,但是棉花中尚未報道是否存在抑制棉花纖維發(fā)育的與TRY和CPC同源基因。
本研究利用電子克隆和RT-PCR相結(jié)合的方法從徐州142無絨無
3、絮突變體棉花中克隆到棉花TRY基因。經(jīng)過RT-PCR克隆后測序,棉花TRY基因ORF(Open read frame)全長270bp,編碼89個氨基酸,其蛋白質(zhì)由18種氨基酸組成,其基因?qū)崪y序列的ORF堿基序列與電子克隆的ORF的堿基序列僅有一個位點(diǎn)的差異,各自的ORF翻譯為蛋白后,其氨基酸序列僅有一個位點(diǎn)的差異,表明電子克隆所得基因序列具有很強(qiáng)的真實(shí)性。
利用生物信息學(xué)分析,該蛋白分子量為10638.1 Da;理論等電點(diǎn)
4、pI:8.66;原子組成是C461H734N140O136S7;消光系數(shù)280nm :19605;不穩(wěn)定系數(shù)是75.26;脂肪系數(shù)是61.35;總平均親水性為-0.899。同擬南芥TRY蛋白一樣,不存在信號肽、糖基化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)、卷曲螺旋結(jié)構(gòu)。同擬南芥TRY蛋白一樣定位于細(xì)胞核中,同屬于不穩(wěn)定、疏水性蛋白,MYB類轉(zhuǎn)錄因子。功能預(yù)測表明,棉花TRY基因編碼的蛋白在細(xì)胞內(nèi)部將執(zhí)行同擬南芥TRY基因編碼的蛋白相似的功能。
將
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