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1、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV),屬于動(dòng)脈炎病毒科動(dòng)脈炎病毒屬,為單股正鏈RNA病毒,基因組全長(zhǎng)約15kb,含有9個(gè)開(kāi)放性閱讀框。開(kāi)放性閱讀框1a(ORF1a)和開(kāi)放性閱讀框1b(ORF1b)占整個(gè)基因組的80%。ORF1a上游編碼一個(gè)單個(gè)的聚合蛋白1a(pp1a),該聚合蛋白被預(yù)測(cè)可被切割成8個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白,即NSP1-8。ORF1b下游編碼一個(gè)聚合蛋白,其與pp1a共同參與核糖體移碼的機(jī)制。ORF1ab的基因產(chǎn)物與聚合蛋白1ab(
2、pp1ab)有關(guān)。ORF1b編碼的聚合蛋白可被水解蛋白酶裂解,形成NSP9-12的多肽。剩余的開(kāi)放性閱讀框(2a,2b和3-7)編碼病毒的結(jié)構(gòu)性糖蛋白2a、3、4、5(GP2a,GP3,GP4,GP5),非糖基化的2b/E,膜蛋白和核蛋白。
RNA干擾(RNAi)是小干擾RNA分子引起的自然發(fā)生的基因抑制的細(xì)胞機(jī)制,其中這些siRNA與靶基因的某些區(qū)域具有同源性。RNAi的應(yīng)用可通過(guò)兩種類型的分子調(diào)節(jié):一種是化學(xué)合成的雙鏈
3、小干擾RNA(siRNA),另外一種是連接載體的小發(fā)夾RNA(shRNA)。為了達(dá)到shRNA有效構(gòu)建的高效能和可持續(xù)的效應(yīng),通常利用低拷貝數(shù)的shRNA,減少脫靶效應(yīng),并且其可誘導(dǎo)哺乳動(dòng)物細(xì)胞產(chǎn)生長(zhǎng)效性的RNA沉默,而小干擾RNA在轉(zhuǎn)染的動(dòng)物細(xì)胞中的效應(yīng)相比較而言,比較短暫。最近幾年,RNA干擾作為一種實(shí)驗(yàn)室工具從而被廣泛應(yīng)用,主要用于病毒和細(xì)胞基因功能的研究,從而達(dá)到識(shí)別基因調(diào)節(jié)病毒感染和復(fù)制的目的,并且可作為一種新的治療病毒感染的
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