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1、為了降低草魚養(yǎng)殖水體中的氨氮及亞硝酸鹽等污染物,通過定向富集的方法篩選到一株具有良好脫氮性能的施氏假單胞菌(Pseudomonas stutzeri)SC221。用鈷60對(duì)該菌進(jìn)行輻射誘變,發(fā)現(xiàn)該菌的反硝化脫氮能力從50mg/L提高到了100mg/L。經(jīng)過輻射誘變后的菌株被命名為SC221-M。隨后研究了不同環(huán)境條件(不同氮源、碳源、碳氮比和溫度)對(duì)SC221-M生長(zhǎng)、脫氮率及反硝化酶基因表達(dá)的影響,結(jié)果表明SC221-M的最佳脫氮條件
2、為:氮源為亞硝酸鈉、碳源為檸檬酸鈉,碳氮比為4-8,溫度為20-35℃。環(huán)境因素能夠顯著影響SC221-M的生長(zhǎng)及其脫氮率,且脫氮率與反硝化酶基因的表達(dá)量之間有一定的相關(guān)性。
通過Illumina Hiseq2000平臺(tái)測(cè)序和序列組裝,發(fā)現(xiàn)施氏假單胞菌SC221-M的基因組大小為4545027bp,GC含量為64.01%,共131個(gè)scaffold,399個(gè)contig。與參考菌株DSM4166的基因組進(jìn)行比對(duì),發(fā)現(xiàn)SC221
3、-M基因組共有60641個(gè)SNP,基因區(qū)內(nèi)的同義突變?yōu)?3396個(gè),非同義突變?yōu)?0743個(gè)。InDel分析顯示,基因組中沒有插入或缺失突變。SC221-M中的nar、nap、nit、 nor及nos反硝化酶相關(guān)基因在基因組中呈簇狀分布,且SC221-M的NirS和NosZ蛋白序列與DSM4166和A1501的同源性較高,提示施氏假單胞菌SC221-M與A1501和DSM4166之間有著類似的反硝化機(jī)制。
研究了SC221-M
4、及其復(fù)合菌制劑對(duì)草魚養(yǎng)殖水體水化學(xué)指標(biāo)的影響。試驗(yàn)設(shè)置了5個(gè)不同的試驗(yàn)組,分別在1400L水體中添加0CFU/ml SC221-M、1×105CFU/ml SC221-M、1×105CFU/ml蠟樣芽孢桿菌BSC24、1×105CFU/ml的復(fù)合菌粉(SC221-M與BSC24等比例混合而成)和3×105CFU/ml的復(fù)合菌粉組。經(jīng)過9d的飼養(yǎng)試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,活菌制劑組水體中的TDS、氨氮、亞硝酸鹽、總無機(jī)氮、總氮、COD、BO
5、D等水化學(xué)指標(biāo)有不同程度的降低,且復(fù)合菌的效果要明顯好于單一菌劑。該結(jié)果說明有益微生物之間的相互協(xié)同作用能有效改良草魚養(yǎng)殖水體的水質(zhì)。
采集草魚養(yǎng)殖試驗(yàn)第9d的對(duì)照組、BSC24組、SC221-M組和混合菌組的水樣,提取細(xì)菌總DNA,利用16S rDNA V3引物對(duì)各樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增,再使用Roche454 GS FLX Titanium測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,并采用Qiime、Megan、Cytoscape等軟件對(duì)所測(cè)序列進(jìn)行分
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