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1、SLE基因定位:人類疾病之范例?,Stephen S. Rich, Ph.D.Department of Public Health SciencesWake Forest University School of Medicine,簡單與復(fù)雜性狀之比較,簡單性狀 復(fù)雜性狀-少見
2、 - 常見- 單個基因(孟德爾法則) - 許多基因(寡基因的)- 重度突變 - 輕微突變- 明顯的表型效應(yīng) - 小的表型效應(yīng),復(fù)雜疾病之難點,復(fù)雜的基礎(chǔ)生物學機制導(dǎo)致難于確定復(fù)雜疾病易感性相關(guān)基因 - 表型異質(zhì)性 - 遺傳異質(zhì)性 - 基因-環(huán)境相互作用針對輕微效應(yīng)易感基因(QTLs),目
3、前的研究手段有限遺傳研究樣本規(guī)模,基因-環(huán)境相互作用,基因-環(huán)境相互作用:復(fù)雜遺傳疾病,遺傳/宿主易感性,環(huán)境影響,臨床前期(危險因素或疾病易感性標記物),出現(xiàn)臨床癥狀(可逆或不可逆的器官結(jié)構(gòu)和功能改變),,,,,,如何發(fā)現(xiàn)一個基因,確定一個人群臨床評價連鎖分析-基因組篩選精細定位和基因定位基因鑒定/序列變異體功能基因組:基因表達,臨床評價問題,定義疾病表型 病史,亞臨床后果的證據(jù),以及通過臨床檢查進行證實
4、 具有不同資料的門診記錄對下述問題有肯定答案: - “您是否曾經(jīng)被診斷為… …” - “如果是,這種情況是否發(fā)生過一次以上?”標準化問卷標準化協(xié)議研究協(xié)作和人員培訓質(zhì)量控制/質(zhì)量保障,人群選擇,表現(xiàn) - 孤立的,混合的或者近交的 - 混合的、異質(zhì)性人群家族結(jié)構(gòu) - 無關(guān)個體 - 家族 父母和子女 擴大的家族:家系來源 - 單一人種 - 多種人
5、種,連鎖分析示例,受累的同胞家系,系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE),SLE是一種慢性自身免疫炎癥性疾病,以自身抗體的產(chǎn)生為特征SLE是一種臨床異質(zhì)性疾病,可導(dǎo)致多系統(tǒng)損害,如關(guān)節(jié)、皮膚、血液和腎臟SLE多發(fā)生于育齡期婦女(>90%)美國SLE發(fā)生率約為40-45例/100,000(Hochberg 1997),SLE的家族性,SLE具有較強的遺傳成分 MZ孿生子的同病率增加(Deapen et al.,1992,Reichli
6、n et al.,1992) 同胞間患病風險增加(Δs=10-20;Vyse and Todd,1996)SLE不表現(xiàn)為單純孟德爾遺傳模式,可能包括:,受累的親屬配對集,Minnesota cohort - 187對 SLE同胞配對家族 - 6p11-21,16q13,14q21-23,20p12.3 Oklahoma cohort - 94 個擴大的多重家系 - 1q23,13q32,20q
7、13,1q31種族特異性效應(yīng),SLE聯(lián)合基因組掃描的NPL回歸分析,聯(lián)合基因組掃描SLE標本的相似性和差異性,聯(lián)合基因組掃描SLE在不同種族中的差異,總結(jié),狼瘡SCOR聯(lián)合基因組掃描為SLE在數(shù)個染色體區(qū)域的定位提供了證據(jù):1q,4p,4q,6,7p,16,20除第6號染色體之外,我們樣品的連鎖峰值以以白人家系為主我們的數(shù)個連鎖信號被已有報道的一些基因組掃描數(shù)據(jù)相佐證SCOR中對這些連鎖區(qū)域的精細定位工作正在進行中,其目標之一是
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