芽胞桿菌種類脂肪酸鑒定與分子鑒定方法的比較

1、期刊文獻(xiàn)目 錄芽胞桿菌種類脂肪酸鑒定與分子鑒定方法的比較..........................................................1福建茶園土壤菊酯類農(nóng)藥調(diào)查.....................................................................................13柑橘木虱成蟲過冷卻點及結(jié)冰點的測定(1 月份).........

2、.................................................19不同致病性青枯雷爾氏菌發(fā)酵液紫外掃描...................................................................23短短芽孢桿菌 FJAT-0809-GLX 的基因預(yù)測及基因注釋..............................................28酶解后

3、 BT、BTA 與小菜蛾 BBMVs 的相互作用的研究...............................................34漳州香蕉枯萎病株體內(nèi)細(xì)胞壁降解酶的比較...............................................................40期刊文獻(xiàn)芽胞桿菌種類脂肪酸鑒定與分子鑒定方法的比較劉國紅 劉國紅 1，2，林營志 ，林營志 1, 劉波 劉波 1（1 福

4、建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物資源研究所， 福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)生物資源研究所，350003；2 福建農(nóng)林大學(xué) 福建農(nóng)林大學(xué), 350002）摘要： 摘要：芽胞桿菌在自然界中分布廣泛，因此芽胞桿菌也具有悠久的研究歷史，但是其分類地位一直處于變化之中。為了尋找一種簡單快速的分類手段，本文基于 ITS 序列和脂肪酸鑒定方法對從土壤中分離得到的 16 株芽胞桿菌進(jìn)行分類研究，與分子鑒定結(jié)果相比，脂肪酸種的鑒定準(zhǔn)確率可達(dá)到 99%以上。通過生物軟件 S

5、PSS 和 Mega 分別對 16 株菌進(jìn)行聚類分析，結(jié)果表明脂肪酸比 ITS 更適合于芽胞桿菌的分類研究，本根據(jù)脂肪酸成分可以將 16 株芽胞桿菌準(zhǔn)確的聚在一起，而 ITS 則不能。芽胞桿菌特征性脂肪酸為 15:0 ANTEISO 和 15:0 ISO，但不同種芽胞桿菌的此類脂肪酸含量不同。本文選取芽胞桿菌三大類菌群主要特征性脂肪酸的含量比例（15:0ISO/15:0 ANTEISO）進(jìn)行了分析。其中比較特殊的為蠟狀芽胞桿菌類群，蠟

6、狀芽胞桿菌主要脂肪酸為 15:0ISO，其次為 13:0ISO，而15:0 ANTEISO 的含量很低非主要類型，15:0ISO/15:0 ANTEISO 的比值約為 5.6-7.9。簡單芽胞桿菌群主要脂肪酸為 15:0 ANTEISO 和 15:0ISO， 15:0ISO/15:0 ANTEISO 比值約為 1/6 左右。巨大芽胞桿菌類群主要脂肪酸15:0ISO 和 15:0 ANTEISO 含量相近，其余脂肪酸遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于這兩種主

7、要脂肪酸。巨大芽胞桿菌的 15:0ISO/15:0 ANTEISO 的比值為約 4/5-5/4，菌株 4500 為短小芽胞桿菌，其 15:0ISO/15:0 ANTEISO 比值約為 2。短小芽胞桿菌和巨大芽胞桿菌脂歸為一類是因為其脂肪酸類型相近，但含量并不同?？莶菅堪麠U菌群主要脂肪酸 15:0ISO 的含量小于 15:0 ANTEISO，15:0ISO/15:0 ANTEISO 的比值為 1/3-2/3。綜上所述，根據(jù)以上所述，芽胞桿

8、菌主要脂肪酸含量和類型可以快速地初步判斷未知菌株屬于哪個類群，表明脂肪酸鑒定可以成為一種快速、有效、簡單的芽胞桿菌分類鑒定方法。關(guān)鍵詞：芽胞桿菌；脂肪酸類型； 關(guān)鍵詞：芽胞桿菌；脂肪酸類型；ITS 序列；分類 序列；分類Comparison of Bacillus species identification based on ITS and fatty acid analysisGuohong Liu1,2, Yingzhi Lin1

9、, Bo Liu1（1Fujian Academy of Agricultural Sciences, 35003; 2 Fujian Agriculture and Forestry University, 350002）Abstract: Bacillus species are widely distributed in nature. Although the study of genus Bacillus has a long

10、 history, its taxonomic status has been in changes. In order to find out a simple and rapid means for identification, 16 strains of Bacillus species isolated from soil were studied based on ITS sequences and fatty acids

11、analysis. FA Identification results accuracy rate was 99%. Through biological software of SPSS and Mega cluster analysis, fatty acids were found to be better for Bacillus identification than ITS sequences. In this paper

12、, we could make all the strains cluster together, by FA, but ITS could not. The major fatty acid of genus Bacillus was 15:0 ANTEISO and 15:0 ISO, author analyzed the major FA ratio of three group. Bacillus cereus group w

13、as special, its major FA was 15:0ISO, and 13:0ISO，but 15:0 ANTEISO had very lower profile. The ratio of Bacillus cereus group major FA 資助項目： 資助項目： 國家 948 項目子專題：高效新型微生物資源引進(jìn)與創(chuàng)新（2011-G25）；福建省科技項目公益專項：生物農(nóng)藥行業(yè)特色芽孢桿菌資源庫的建立及生防菌株