羊傳染性膿皰病毒GIF基因的克隆及序列分析.pdf

1、根據(jù)已發(fā)表的羊傳染性膿皰病毒NZ2株的基因序列，應用計算機程序設計合成一對針對羊傳染性膿皰病毒GIF基因的特異性引物，對羊傳染性膿皰病毒內(nèi)蒙分離株OV-nm-05進行PCR擴增，擴增產(chǎn)物與pEASY—T1載體連接，轉(zhuǎn)化至感受態(tài)大腸桿菌DH5a中，成功得到GIF基因的陽性克隆，送測序公司進行測序得到該病毒GIF的基因序列。該病毒GIF基因序列長約1280bp左右，其中包括GIF基因的編碼區(qū)和左右兩邊的非編碼區(qū)。應用計算機軟件將測定的基因序

2、列及其推導的氨基酸序列與7株參考毒株進行比較。
　　結(jié)果表明，內(nèi)蒙古分離株OV-nm-05堿基序列與OV-NZ2、OV-D1701、OV-IA82、OV-SA00、OV-F07.808R、OV-MUK59/05、OV-F94.848R的同源性分別為95.7％、98.2%、96.7%、95.5%、95.9%、95.5%、95.1%；氨基酸序列同源性分別為95.1%、90.2%、95.1%、94.7%、94.7%、95.1%、93.6