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文檔簡介
1、本研究采用RT-PCR對3株四川分離株IBV進行了S2、E基因的擴增,并對3株IBV進行了S2、E基因的序列分析。采用SDS-Pro.K法抽提M41標準株及本課題組分離的IBV基因組RNA。根據(jù)Genbank公布的禽傳染性支氣管炎病毒呼吸型標準毒株IBVM41基因組全序列設計了擴增S2、E基因的兩對引物。用S2基因的引物對4株IBVM41、SAIBWS、SAIB4、SAIBWJ進行了RT-PCR擴增,均獲得了長約1.5kb特異條帶(注示
2、:本研究所擴S2基因為部分S2基因)。用E基因的引物對4株IBVM41、SAIBWS、SAIB4、SAIBWJ進行了RT-PCR擴增,均獲得了長約400bp特異條帶?! AIBWS、SAIB4、SAIBWJ三株的RT-PCR特異擴增條帶插入到PMD18-T質(zhì)粒多克隆位點,構(gòu)建了含目的基因片段的克隆質(zhì)粒,轉(zhuǎn)化JM109載體菌,篩選獲得S2、E基因陽性克隆菌株。對S2基因的克隆質(zhì)粒的外源片段序列測定表明,該片段含有IBVS2基因序列,
3、其基因長約1437bp,編碼約479個氨基酸。對E基因的克隆質(zhì)粒的外源片段序列測定表明,該片段含有IBVE基因全序列,其基因全長約330bp,編碼約110個氨基酸。 與Genbank公布的IBVM41標準株S2基因相比,SAIBWS、SAIB4、SAIBWJS2基因核苷酸序列同源率分別為85.5%、84.4%、84.4%,相應的氨基酸序列同源率分別為86.8%、88.7%、81.6%。與Genbank公布的IBVM41標準株E基因相
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