小鼠SVZ區(qū)lncRNA的鑒定與表達(dá)研究.pdf

1、大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組分析表明,絕大多數(shù)真核生物的基因組可以被轉(zhuǎn)錄,形成一個(gè)復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄本網(wǎng)絡(luò),其中只有少部分轉(zhuǎn)錄物與蛋白質(zhì)編碼有關(guān),而大部分為沒有蛋白質(zhì)編碼潛能的長(zhǎng)度大于200核苷酸的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)。lncRNA廣泛存在于細(xì)胞和組織中,具有發(fā)育階段和細(xì)胞類型特異的時(shí)空表達(dá)調(diào)控模式。目前的研究表明,lncRNA可以在轉(zhuǎn)錄水平,轉(zhuǎn)錄后水平和蛋白質(zhì)翻譯水平調(diào)節(jié)生物體基因的表達(dá),從而調(diào)控基因印記、X

2、染色體失活、染色質(zhì)修飾、細(xì)胞周期、選擇性剪切、細(xì)胞分化、細(xì)胞重編程、細(xì)胞凋亡、亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的定位、神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育和器官形成等一系列重要的生命活動(dòng),有些lncRNA甚至與包括癌癥在內(nèi)的多種人類疾病的發(fā)生發(fā)展有密切的關(guān)系,表明lncRNA在生物體生命活動(dòng)過(guò)程中的重要作用。
　　長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)在哺乳動(dòng)物的神經(jīng)系統(tǒng)中廣泛表達(dá),對(duì)神經(jīng)系統(tǒng)的發(fā)育具有極其重要的作用。目前人們采用全腦或不同神經(jīng)解剖學(xué)區(qū)域來(lái)研究神經(jīng)系統(tǒng)lncRNA。

3、由于同一神經(jīng)解剖學(xué)區(qū)域細(xì)胞的不均一性,上述研究不能檢測(cè)到在神經(jīng)系統(tǒng)特定細(xì)胞類群低豐度表達(dá)且起關(guān)鍵調(diào)控作用的lncRNA。我們通過(guò)單細(xì)胞高通量深度測(cè)序,從小鼠側(cè)腦室室管膜下區(qū)(SVZ)鑒定了50個(gè)新的多外顯子lncRNA。這些新lncRNA具有組織和細(xì)胞類型特異的時(shí)空表達(dá)調(diào)控模式,有些lncRNA僅在SVZ區(qū)細(xì)胞群體中的極少數(shù)單細(xì)胞中表達(dá),在多細(xì)胞水平上難以發(fā)現(xiàn)。這些在特定細(xì)胞類群低豐度表達(dá)的lncRNA可能在神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育中起關(guān)鍵調(diào)控作用