大針茅質(zhì)膜水通道蛋白基因(SgPIPs)全長cDNA序列的克隆及序列分析.pdf

1、水通道蛋白不但為水分跨細(xì)胞膜的運輸提供了一條選擇性通道，而且水通道蛋白在植物種子萌發(fā)、細(xì)胞伸長、氣孔運動、受精及植物逆境應(yīng)答中起重要作用。研究以亞洲中部特有的典型草原種大針茅（Stipa grandis P.Smirn）為材料，通過反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（RT-PCR）和快速分離 cDNA末端技術(shù)（RACE），克隆得到大針茅的質(zhì)膜水通道蛋白基因（SgPIPs）的全長cDNA序列，并對其進行生物信息學(xué)分析。主要結(jié)果如下：
　　共獲得S

2、gPIPs的9個中間片段cDNA序列，22個3′端cDNA序列，9個5′端cDNA序列。克隆到3個SgPIPs的cDNA全長序列，分別為SgPIP1-1、SgPIP1-2和SgPIP1-3。
　　SgPIP1-1全長cDNA序列為991bp，包含15bp的5′非翻譯區(qū)，870bp的開放閱讀框，106bp的3′非翻譯區(qū)，編碼289個氨基酸。SgPIP1-2全長cDNA序列為1248bp，包含15bp的5′非翻譯區(qū)，870bp的開放閱

3、讀框，363bp的完整3′非翻譯區(qū)，編碼289個氨基酸；SgPIP1-3全長cDNA序列為1068bp，包含58bp的5′非翻譯區(qū)，867bp的開放閱讀框，143bp的完整3′非翻譯區(qū)，編碼288個氨基酸。
　　SgPIP1-1、 SgPIP1-2、SgPIP1-3推導(dǎo)氨基酸序列表明：它們不但具有MIP家族的信號序列 SGXHXNPAVT，而且具有質(zhì)膜水通道蛋白的特征信號序列GGGANXXXXGY和TGI/TNPARSI/FGAA

4、I/VI/VF/YN。同時具有水通道蛋白典型的6個跨膜區(qū)和兩個NPA盒單元。
　　SgPIP1-1、SgPIP1-2、SgPIP1-3的核苷酸序列和禾本科物種構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹表明：SgPIP1-1和SgPIP1-3進化關(guān)系最近，之后與玉米、甘蔗、水稻聚為一類。SgPIP1-2與大麥、小麥的進化關(guān)系最近。SgPIP1-1、SgPIP1-2、SgPIP1-3推導(dǎo)的氨基酸序列和大麥PIPs基因家族的PIP1和PIP2構(gòu)建系統(tǒng)進化樹，結(jié)果