使用高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)肌張力障礙患者進(jìn)行基因篩查.pdf

1、肌張力障礙(dystonia)是一種運(yùn)動(dòng)障礙性疾病，通常以持續(xù)或偶發(fā)的肌肉收縮而引起的異常運(yùn)動(dòng)或姿勢(shì)為特征。肌張力障礙的臨床表現(xiàn)根據(jù)受累肌肉的部位、收縮強(qiáng)度和不同肌肉的組合而有不同表現(xiàn)?，F(xiàn)階段對(duì)肌張力障礙進(jìn)行臨床診斷多按照臨床表現(xiàn)和病史依據(jù)醫(yī)生的臨床經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行診斷，難以滿足臨床準(zhǔn)確診斷的要求。而各種輔助檢查也做不到準(zhǔn)確快速。臨床診斷中正急需一種快速準(zhǔn)確的診斷方法。
　　目的：應(yīng)用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)結(jié)合I

2、on Torrent PGM高通量測(cè)序平臺(tái)檢測(cè)肌張力障礙患者的目標(biāo)基因突變，在找尋肌張力障礙致病基因新突變的基礎(chǔ)上評(píng)估高通量測(cè)序技術(shù)在肌張力障礙臨床診斷上應(yīng)用的可能性。
　　方法：使用的個(gè)性化定制panel包括25個(gè)肌張力障礙明確致病基因及相關(guān)易感基因的全部外顯子區(qū)域，應(yīng)用Ion AmliSeq多重PCR定制序列捕獲系統(tǒng)對(duì)病人的目的基因區(qū)域進(jìn)行捕獲，通過(guò)Ion Torrent PGM高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行靶向重測(cè)序，對(duì)得到的變異數(shù)據(jù)進(jìn)

3、行肌張力障礙候選基因突變分析。
　　結(jié)果：本研究共使用Ion Chip318芯片6張，318V2芯片12張，平均測(cè)序深度為134±23，覆蓋度為96.12％±0.71％，單張芯片最高產(chǎn)生數(shù)據(jù)達(dá)到900MB(IonChip318V2)。經(jīng)測(cè)序后數(shù)據(jù)分析和Sanger測(cè)序驗(yàn)證，在肌張力障礙的致病基因上共檢測(cè)到15(60％，15/25)個(gè)突變，其中4種為已知變異，11種為之前未報(bào)道的新突變。
　　結(jié)論：應(yīng)用Ion AmliSeq多