MAPS-基因整合位點高通量測序分析的新方法.pdf_第1頁
已閱讀1頁,還剩69頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內容提供方,若內容存在侵權,請進行舉報或認領

文檔簡介

1、基因整合是指外來的DNA分子插入到宿主基因組中的基因突變事件,包括轉座子、逆轉錄病毒、逆轉錄基因治療載體等在自然或人工過程中的整合行為?;蛘辖M從全基因組水平分析整合事件,是病毒致癌機制研究,癌基因整合突變篩選和基因治療載體開發(fā)等研究領域重要的遺傳學分析手段。
   目前,基因整合位點主要通過PCR方法分離并經測序鑒定。第二代測序技術的出現(xiàn)簡化了整合位點分析的過程。反向PCR,接頭PCR,線性擴增PCR等各種翼側序列擴增技術與

2、高通量的454測序技術結合,為相關領域的研究積累了大量寶貴的整合信息。為了獲取更全面的基因整合信息,更新的方法應該達到基因整合組分析的要求。雖然,最新的非限制性線性擴增PCR和Mu噬菌體介導PCR具有分析全基因組整合位點的潛能,但是兩者都存在一定的技術難度。
   本論文開發(fā)的大規(guī)模錨定平行測序(massive anchored parallel sequencing,MAPS)能夠從全基因組水平分離和鑒定整合序列。MAPS利用

3、機械能將DNA片段化,從而避免了酶切引起的整合位點分離偏好并為后期整合位點的識別增加置信。本法改造Illumina的測序接頭使之介導整合序列的分離和擴增,并由此結合Illumina雙端測序技術用以高通量鑒定整合位點。以乙肝陽性的肝癌組織DNA樣品為例,單次多元化測序分析成功地在6對(癌和癌旁)組織樣品中鑒定了68個整合位點,而且結果定量地反映了各個整合位點的克隆頻率。最后,本文也分析了非限制性和半定量的MAPS方法具有很強的拓展性和移植

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網頁內容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論