玉米全基因組RCI2基因特征及表達(dá)分析.pdf

1、植物總是承受著各種環(huán)境因子的作用。其中尤以非生物逆境影響最為廣泛。Rare-coldinductible(RCI2)基因參與植物非生物逆境耐受。RCI2基因家族普遍存在于生物中,其高度保守,并且編碼小分子、高度疏水性蛋白。RCI2基因調(diào)控細(xì)胞離子代謝,而能影響膜勢(shì)。本研究以生物信息學(xué)方法分析了玉米R(shí)CI2基因家族,包括基因進(jìn)化、表達(dá)。同時(shí),與高粱、小米、水稻和雀麥草進(jìn)行了比較。本研究結(jié)果為探討RCI2基因功能提供了系統(tǒng)性認(rèn)識(shí)。主要研究結(jié)

2、果如下:
　　1.在全基因組水平檢索、驗(yàn)證,獲得了10個(gè)RCI2基因。根據(jù)染色體定位情況命名了這些基因。預(yù)測(cè)了其所編碼蛋白質(zhì)的分子量、等電點(diǎn)。
　　2.構(gòu)建了玉米R(shí)CI2基因進(jìn)化樹(shù)。此外,還構(gòu)建了禾本科植物RCI2基因進(jìn)化樹(shù)。45個(gè)RCI2基因被劃分為三類(lèi)。從整體來(lái)看,ZmRCI2基因主要定位在染色體兩端。ZmRCI2-3,5、ZmRCI2-4,6為片段復(fù)制基因。
　　3.分析了RCI2基因所編碼的蛋白。其氨基酸序列高

3、度保守,形成兩個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。分析了禾本科植物45個(gè)RCI2蛋白基序。Motif1,2普遍存在,代表跨膜結(jié)構(gòu)域。Motif3多位于蛋白羧基端。
　　4.分析了10個(gè)玉米R(shí)CI2基因啟動(dòng)子。ZmRCI2基因大多含有三種順式作用元件,即:ABRE、LTRE和DRE。ZmRCI2-10啟動(dòng)子含有最多ABRE順式調(diào)控元件。
　　5.dbEST用于RCI2基因表達(dá)分析,10個(gè)RCI2基因都有EST表達(dá)記錄。ZmRCI2-1具有表達(dá)特異性