全基因組發(fā)掘甜橙脅迫應(yīng)答ERF類基因及其表達(dá)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、AP2/EREBP是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子家族,而ERF是其中的一個亞族,研究表明,ERF類轉(zhuǎn)錄因子廣泛參與植物生長發(fā)育及非生物脅迫,在植物抗性分子育種中有較大的應(yīng)用潛力,然而對柑橘逆境應(yīng)答AP2/EREBP類基因發(fā)掘及鑒定的研究還較少。本研究基于甜橙(Citrus sinensis)基因組數(shù)據(jù)庫,發(fā)掘甜橙AP2/EREBP轉(zhuǎn)錄因子家族成員,分析其表達(dá),以期篩選出受逆境誘導(dǎo)的AP2/EREBP類基因,從而為柑橘抗逆遺傳改良提供優(yōu)質(zhì)的基因

2、資源。
  基于甜橙基因組數(shù)據(jù)庫,通過BLAST比對分析,共獲得126條AP2/EREBP基因序列,根據(jù)序列和結(jié)構(gòu)特點,它們分為5個亞族,即AP2亞族(18個成員)、RAV亞族(4個成員)、ERF亞族(60個成員)、DREB亞族(38個成員)和其他類(6個成員)。根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,ERF亞族和DREB亞族又進(jìn)一步分為10個亞組,對不同亞族間結(jié)構(gòu)域的分析,也發(fā)現(xiàn)了一些其他的保守結(jié)構(gòu)域。
  通過表達(dá)分析,在甜橙和枳中分別篩選出

3、19個和15個顯著響應(yīng)低溫的ERF類基因??寺〕銎渲械膬蓚€基因,CsERF#10、CsERF#36和PtERF#10、PtERF#36,它們均可被多種脅迫誘導(dǎo)。CsERF#10、PtERF#10和CsERF#36、PtERF#36基因間序列差異較小,氨基酸序列上AP2/ERF保守區(qū)域基本一致。亞細(xì)胞定位實驗也表明,它們均定位于細(xì)胞核。
  通過根癌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化,獲得CsERF#36和PtERF#36超表達(dá)轉(zhuǎn)基因煙草植株。T1代轉(zhuǎn)基因

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