玉米苗期耐鹽性全基因組關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、玉米是全球最重要的糧食作物之一，鹽脅迫是限制玉米生產(chǎn)的重要非生物逆境脅迫。玉米種質(zhì)資源中擁有豐富的耐鹽變異，通過挖掘耐鹽種質(zhì)中優(yōu)異耐鹽基因?qū)ρ芯坑衩啄望}機(jī)制以及遺傳改良有著重要作用。本研究主要以368份玉米自交系為研究材料，鑒定苗期耐鹽性，通過全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法挖掘玉米耐鹽性基因，并將玉米ZmCIPK基因家族作為候選基因進(jìn)行耐鹽性關(guān)聯(lián)分析。主要研究結(jié)果如下:
　　1、以耐鹽水平(STL)、鹽脅迫后與正常生長條件下苗期株高比率(

2、SHR)、苗期鮮重比率(SFWR)、苗期干重比率(SDWR)為指標(biāo)，對(duì)368份玉米自交系進(jìn)行了苗期耐鹽性鑒定，發(fā)現(xiàn)不同自交系系對(duì)鹽的耐受性有明顯的差異。進(jìn)一步將四個(gè)指標(biāo)都完整的269份自交系進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)，共鑒定出DAN3130、150、CML298、SY3073，GEMS46等25份耐鹽材料;B111、BY4839、CIMBL142、CML426、HZS等25份鹽敏感材料。
　　2、用全基因組關(guān)聯(lián)分析方法對(duì)玉米苗期耐鹽性進(jìn)行分析，

3、共檢測(cè)到了145個(gè)與耐鹽性相關(guān)的顯著性位點(diǎn)，包含75個(gè)基因，分布在玉米基因組10條染色體。在這些顯著性位點(diǎn)中，10號(hào)染色體檢測(cè)到了最多的位點(diǎn)，6號(hào)染色體次之，9號(hào)染色體檢測(cè)到的顯著性位點(diǎn)最少。位于3號(hào)染色體的基因Gene14，其關(guān)聯(lián)信號(hào)最強(qiáng)(p=5.12E-07)，同時(shí)被SHR和SDWR兩個(gè)指標(biāo)檢測(cè)到，在玉米數(shù)據(jù)庫中該基因是一未知基因;位于4號(hào)染色體的基因Gene1檢測(cè)到了最多的顯著性位點(diǎn)，該基因編碼一個(gè)C3HC4型鋅指結(jié)構(gòu)蛋白。

4、>　　3、通過對(duì)玉米ZmCIPK基因家族耐鹽性關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)，在MLM和GLM兩個(gè)統(tǒng)計(jì)模型p＜0.05水平下，共有14個(gè)ZmCIPK基因區(qū)域檢測(cè)到了顯著性位點(diǎn):其中ZmCIPK29基因區(qū)域內(nèi)檢測(cè)到了最多的顯著性位點(diǎn)，共有4個(gè)顯著性位點(diǎn)。ZmCIPK4、ZmCIPK1和ZmCIPK12基因區(qū)域內(nèi)分別檢測(cè)到了3個(gè)顯著性位點(diǎn);在MLM模型p＜0.01的水平下，共有3個(gè)ZmCIPK基因（ZmCIPK18、ZmCIPK24-1、ZmCIPK12）區(qū)