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文檔簡介
1、細胞色素蛋白CYP450超家族是一類含血紅素單加氧酶,該家族成員蛋白雖然一級序列存在或多或少的差異,但都呈現(xiàn)出共同的結構特征。特別地,CYP450超家族中某些亞型在人體內(nèi)源性或外源性物質的代謝過程中發(fā)揮了關鍵性作用。
在CYP450超家族中,CYP3A4蛋白是一類活性口袋較大的亞型,在代謝過程經(jīng)常會同時容納多個底物。這些底物(以酮康唑為例)之間的相互作用會對代謝過程產(chǎn)生一定的影響,因此呈現(xiàn)出特殊的代謝動力學,但是其背后機制還有
2、待揭示。
CYP2J2是CYP450超家族中另一個重要亞型,在人體脂肪酸代謝中發(fā)揮重要作用。在心血管系統(tǒng)中,CYP2J2能以花生四烯酸(Arachidonic acid)為主要底物,催化產(chǎn)生氧化二十碳三烯酸(EETs)。該產(chǎn)物能夠保護內(nèi)皮細胞,避免缺氧或缺血性損傷,因此與冠狀動脈疾病及高血壓的發(fā)病機制密切相關。研究發(fā)現(xiàn),一些CYP2J2的突變型(T143A和N404Y)顯著降低催化上述反應的酶活性,但是具體機理還不明確。因此闡
3、明其機制對于冠狀動脈疾病及高血壓等問題的認識與解決十分關鍵。
在本論文中,我們通過分子動力學模擬的分析方法,對上述兩大問題進行了分別探索。對于CYP3A4催化酮康唑代謝過程分析后,我們發(fā)現(xiàn)兩個底物分子及CYP450蛋白之間的pi-pi疊合作用使得第一底物的結合更加穩(wěn)定,加速了催化反應的進行。對于CYP2J2,基于構建野生型及兩種突變型的計算結構,我們分析發(fā)現(xiàn)T143A突變引起了水通道的關閉,阻礙了反應過程的進行;而N404Y突
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