長鏈非編碼RNA遺傳變異及其組織表達(dá)水平與結(jié)直腸癌的關(guān)系研究.pdf

1、目的：
　　結(jié)直腸癌(colorectal cancer，CRC)的發(fā)生發(fā)展是環(huán)境因素與遺傳因素共同作用下多階段、多步驟的過程，基因的遺傳變異可影響腫瘤的易感性，長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA，lncRNA)及其遺傳多態(tài)可能與結(jié)直腸癌的發(fā)生和發(fā)展相關(guān)。在前期研究中發(fā)現(xiàn)了與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險相關(guān)的5個lncRNA SNPs位點(MALAT1rs1194338、RP11-650L2.2rs149941240、R

2、P11-108K3.2rs2470151、RP11-392P7.6rs10845671和RP11-3N2.1rs13230517)。
　　本研究擬分析上述5個與結(jié)直腸癌發(fā)病風(fēng)險相關(guān)的lncRNA SNPs與結(jié)直腸癌的進(jìn)展和預(yù)后的關(guān)系，同時進(jìn)一步明確lncRNA SNP是否通過影響其結(jié)直腸癌組織的表達(dá)進(jìn)而影響結(jié)直腸癌的進(jìn)展和預(yù)后，以發(fā)現(xiàn)潛在的與結(jié)直腸癌進(jìn)展相關(guān)的分子標(biāo)志物。
　　方法:
　　研究以杭州市人民醫(yī)院2013年

3、5月到2013年12月期間和紹興市人民醫(yī)院2015年1月到2015年6月期間確診的193例結(jié)直腸癌患者為研究對象，收集其臨床基線資料，采集其手術(shù)切除的結(jié)直腸癌組織和癌旁組織標(biāo)本，并通過醫(yī)院的隨訪系統(tǒng)獲得其預(yù)后信息。
　　實驗室檢測包括:抽提組織DNA，采用MassARRAY技術(shù)對檢測SNP基因分型;同時，抽提組織RNA，采用定量RT-PCR手段檢測lncRNA組織表達(dá)水平。
　　統(tǒng)計分析包括對研究對象的基本特征進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)描述

4、，并對目的研究因素進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)推斷。其中，采用卡方擬合優(yōu)度檢驗Hardy-Weinberg遺傳平衡;采用配對t檢驗比較lncRNA在結(jié)直腸癌組織與癌旁正常組織的表達(dá)差異;通過方差分析比較不同基因型的lncRNA組織表達(dá)水平差異;采用Cox比例風(fēng)險回歸模型分析lncRNA SNP基因型、不同組織表達(dá)水平對結(jié)直腸癌死亡風(fēng)險的影響，同時采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線，分組比較采用log-rank檢驗。數(shù)據(jù)整理與分析過程主要采用了SA

5、S9.4、GraphPad Prism5等軟件。
　　結(jié)果：
　　研究納入的193例結(jié)直腸癌患者中，男性124人，女性69人，中位隨訪31.5月。
　　由于DNA標(biāo)本存量和質(zhì)量問題，研究最終對153名對象的rs1194338、rs149941240、rs2470151、rs10845671和rs13230517成功進(jìn)行了檢測分型，5個SNPs均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律。對于lncRNA基因多態(tài)性與結(jié)

6、直腸癌病例的預(yù)后生存分析發(fā)現(xiàn)，lncRNA SNP rs1194338、rs149941240、rs2470151、rs10845671和rs13230517的不同基因型與結(jié)直腸癌死亡風(fēng)險不存在有統(tǒng)計學(xué)意義的關(guān)聯(lián)效應(yīng)(P＞0.05)。
　　在lncRNA組織表達(dá)的定量分析中，RP11-108K3.2、RP11-392P7.6和RP11-3N2.1沒有特異的擴增引物，研究最終只對MALAT1和RP11-650L12.2的表達(dá)水平成功

7、進(jìn)行了檢測分析。對于癌組織及其相應(yīng)的癌旁組織的lncRNA組織表達(dá)（ΔCT）差異分析，MALAT1和RP11-650L12.2在結(jié)直腸癌組織的表達(dá)水平低于相應(yīng)的癌旁正常組織，且差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P＜0.05)。同時，對于攜帶不同基因型個體的結(jié)直腸癌組織表達(dá)水平（－ΔΔCT），分析發(fā)現(xiàn)，對于MALAT1rs1194338，不同基因型攜帶者結(jié)直腸癌組織MALAT1表達(dá)水平總體上存在有統(tǒng)計學(xué)意義的臨界差異(P＜0.05)，AA基因型攜帶者其結(jié)

8、直腸癌組織MALAT1表達(dá)水平高于CC基因型攜帶者(P＜0.05);而對于RP11-650L12.2rs149941240，不同基因型攜帶者結(jié)直腸癌組織RP11-650L12.2表達(dá)水平總體上不存在有統(tǒng)計學(xué)意義的差異(P尸＞0.05)。對于oncRNA組織表達(dá)水平與結(jié)直腸癌病例的預(yù)后生存分析發(fā)現(xiàn)，MALAT1、RP11-650L12.2結(jié)直腸癌組織表達(dá)與結(jié)直腸癌的死亡風(fēng)險不存在有統(tǒng)計學(xué)意義的關(guān)聯(lián)(P＞0.05)。
　　結(jié)論：

9、>　　本研究未發(fā)現(xiàn)MALAT1rs1194338、RP11-650L12.2rs149941240、RP11-108K3.2rs2470151、RP11-392P7.6rs10845671、RP11-3N2.1rs13230517不同基因型對結(jié)直腸癌的生存預(yù)后存在影響。本研究發(fā)現(xiàn)，相比癌旁正常組織，MALAT1、RP11-650L2.2在結(jié)直腸癌組織中表達(dá)下調(diào);MALAT1rs1194338不同基因型攜帶者結(jié)直腸癌組織MALAT1表達(dá)存