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文檔簡介
1、目的:
許多微小RNA(microRNAs,miRNAs)在原發(fā)性肝癌(以下簡稱肝癌)中表達異常,提示miRNAs有可能影響肝癌的發(fā)生及發(fā)展過程,但其作用機制尚不完全清楚。帶有血小板凝血酶敏感蛋白樣模體的解聯蛋白金屬蛋白酶9(a disintegrin and metallo-proteinase with thrombospondin motifs-9, ADAMTS9)是新近發(fā)現的腫瘤抑制因子,它在多種癌癥的發(fā)生發(fā)展過程起
2、重要作用。本實驗主要通過實時熒光定量PCR(quantitative Real-time fluorescent quantitative PCR, qRT-PCR)的方法研究人肝癌細胞株SMMC-7721、Huh7、HepG2中miR-32的表達豐度,并通過雙熒光素酶報告基因系統(tǒng)探討miR-32是否對ADAMTS9具有調控作用,從而評價miR-32與ADAMTS9在肝癌細胞中的作用,這將為進一步研究肝癌的發(fā)病機制拓展新的思路,并在肝癌
3、的早期診治及生物治療中擁有廣泛的應用前景。
材料和方法:
1、材料及試劑
人肝癌細胞株SMMC-7721購自中國科學技術研究院上海細胞庫,人肝癌細胞株Huh7、人肝癌細胞株HepG2及人腎上皮細胞293T細胞株來自河北醫(yī)科大學實驗室;miR-32過表達質粒和雙熒光素酶報告基因3’UTR質粒由上海吉凱基因化學技術有限公司構建合成; miR-32-5p inhibitor/NC由廣州銳博生物有限公司合成。
4、> 所用主要試劑有:DMEM高糖(Hyclone),RPMI1640(Gibco);標準胎牛血清(四季青);胰蛋白酶(Trypsin-EDTA)(Solarbio);青鏈霉素混合液(100x)(雙抗 Solarbio);lipofectamine2000(invitrogen);總RNA提取試劑(上海捷瑞公司);雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒、逆轉錄試劑盒、qRT-PCR試劑盒(Promega);逆轉錄引物、實時熒光定量PCR引物(In
5、vitrogen公司)。
2、細胞培養(yǎng)
人肝癌細胞株 SMMC-7721、人肝癌細胞株 Huh7、人肝癌細胞株HepG2及人腎上皮細胞293T細胞株分別以含10%胎牛血清、1%雙抗的DMEM高糖培養(yǎng)基、RPMI1640培養(yǎng)基在37℃、5%CO2的細胞培養(yǎng)箱中常規(guī)培養(yǎng),每2-3天使用0.25%胰蛋白酶進行消化、傳代,取對數期細胞用于后續(xù)實驗。
3、總RNA提取
將細胞用PBS漂洗2次后加入4℃預冷的
6、Trizol lml,冰上放置5min,加入氯仿200ul,劇烈晃動EP管約15s,冰上放置10min后4℃,8800rpm離心15min,將上清液轉移到新的1.5ml RNase-free EP管中,加入0.5ml異丙醇,-20℃放置10min后4℃,8800rpm離心15min,用75%乙醇漂洗一次,再次離心后將乙醇晾干,用20ul滅菌DEPC水溶解沉淀的RNA過夜。用紫外分光光度計讀取OD260/OD280,-80℃保存?zhèn)溆谩?b
7、r> 4、qRT-PCR檢測
?。?)RNA逆轉錄反應:檢測 miR-32的表達時,向總 RNA中加入miR-32特異性莖環(huán)引物:5’-GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACT GCAACTT-3’;檢測ADAMTS9 mRNA表達時,加入逆轉錄試劑盒中的隨機引物。按照逆轉錄試劑盒逆轉錄得到 cDNA,設置反應條件為25℃5min,42℃60min,70℃15min,4℃+∞。
8、(2)qRT-PCR:按照 qRT-PCR試劑盒配制20uL反應體系, miR-32上游引物為:5’-GTGCAGGGTCCGAGGTATT-3’;下游引物為:5’-GCCGCTATTGCA CATTACTAAGTT-3’, ADAMT9上游引物為:5’-CATAATGAACAGGATGGGCCT-3’;下游引物為5’-TTGACCACATCCAGGGGTTG-3’,SYBR Green qRT-PCR擴增反應參數設置:95℃10min
9、,95℃15S,55℃(ADAMTS9 mRNA為57℃)30S,72℃30S,40個循環(huán),每個樣品設置3個平行管,每次實驗重復3次;(3)數據分析相對表達水平用2-??Ct方法計算,miR-32的表達選用U6基因為內參,ADAMTS9 mRNA的表達選用β-actin基因為內參。
5、細胞轉染
miR-32過表達質粒組及 miR-32-5p inhibitor組瞬時轉染人肝癌細胞株SMMC-7721。取處于對數生長
10、期的細胞按1×106個/孔接種于6孔板,隨后置于37℃、5%CO2的培養(yǎng)箱中常規(guī)培養(yǎng)至細胞密度達70%后,采用脂質體法瞬時轉染肝癌細胞株SMMC-7721,miR-32過表達質粒組按質粒(ug):脂質體(ul)=1∶2的比例轉染;miR-32-5p inhibitor組使miR-32-5p inhibitor終濃度為150nm進行轉染,轉染后將細胞置于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)6 h后更換為含血清培養(yǎng)基,24h后收集細胞,提取RNA。
11、6、雙熒光素酶報告基因檢測
取處于對數生長期的人腎上皮細胞293T細胞接種于24孔板,置于37℃、5%CO2的細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)20小時,細胞密度達70%,將細胞分為6組:共轉染 PmiR-ADAMTS9-NC和 mir-NC組、共轉染PmiR-ADAMTS9-NC和 miR-32組、共轉染 PmiR-ADAMTS9-WT和mir-NC組、共轉染 PmiR-ADAMTS9-WT和 miR-32組、共轉染PmiR-ADAMTS9-
12、Mut和miR-32-NC組、共轉染PmiR-ADAMTS9-Mut和miR-32組,轉染方法同前。轉染24 h后吸盡細胞培養(yǎng)液,使用1xPBS清洗細胞2遍,每孔加入100uL稀釋好的1xPLB,搖床常溫條件下進行裂解。將白色不透光的96孔酶標板置于多功能酶標儀內,每孔加入之前的細胞裂解液20uL,做3個平行孔,實驗重復3次,每孔分別加入100uL預先混好的螢火蟲熒光素酶檢測緩沖液,測定 Firefly luciferase,檢測完成后
13、加入100uL海腎熒光素酶檢測工作液,測定 Renilla luciferase,用Firefly luciferase除以Renilla luciferase,所得值作為相對熒光素酶活性。
7、統(tǒng)計學處理實驗數據以mean±SD表示,實時熒光定量PCR采用單因素方差分析,雙熒光素酶報告基因檢測采用t檢驗比較組間差異,實驗所得數據資料采用SPSS17.0統(tǒng)計分析軟件分析, P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
結果:
14、r> 1、SMMC-7721, Huh7, HepG人肝癌細胞株中miR-32的表達
使用紫外分光光度計檢測所提取的RNA濃度及純度,發(fā)現3株肝癌細胞總RNA的A260nm/A280nm比值在1.8~2.0之間,說明總RNA純度較高,未見明顯降解。
qRT-PCR的熔解曲線顯示,miR-32及U6基因分別在80℃與82℃溶解曲線呈單峰,說明引物特異性良好, qRT-PCR結果可信。從擴增曲線中可以看出,擴增曲線均為
15、S型曲線,各個樣本的模板質量良好,可得到較合適有效的擴增。分析結果顯示:3株肝癌細胞(SMMC-7721,HepG2,Huh7)中miR-32的表達無統(tǒng)計學差異(P>0.05),我們選用SMMC-7721進一步研究。
2、人肝癌細胞株SMMC-7721轉染后miR-32及ADAMTS9 mRNA表達情況
使用紫外分光光度計檢測所提取的RNA/質粒濃度及純度,溶解曲線及擴增曲線分析方法同2.1。
SMMC-7
16、721轉染后各組間相比較, miR-32表達豐度分析結果顯示:miR-32質粒轉染組中miR-32表達上調(P<0.05),轉染miR-32-NC質粒組則無明顯差異(P>0.05);miR-32-5p inhibitor轉染組中miR-32表達下調(P<0.05),轉染miR-32-5p-NC質粒組則無明顯差異(P>0.05)。
SMMC-7721轉染后各組間相比較,ADAMTS9 mRNA表達情況分析結果顯示:轉染miR-3
17、2質粒組與轉染miR-32-NC質粒組ADAMTS9 mRNA相比較表達下調(P<0.05),與空白組相比則無明顯變化(P>0.05);轉染miR-32-5p inhibitor組與轉染miR-32-5p inhibitor NC組ADAMTS9 mRNA相比較表達上調(P<0.05),與空白組相比較表達上調(P<0.05)。
3、雙熒光素酶報告基因檢測結果
293T細胞轉染24h后檢測熒光素酶活性并將其標準化,結果
18、顯示:在轉染PmiR-ADAMTS9-wt組中,轉染miR-32同miR-32-NC相比熒光素酶活性降低( P<0.05);當同時轉染miR-32時, PmiR-ADAMTS9-wt組與PmiR-ADAMTS9-mut組相比熒光素酶活性也同樣出現了降低(P<0.05),結合以上結果說明miR-32可與ADAMTS9 mRNA3'-UTR結合,抑制熒光素酶活性,當未結合時,熒光素酶活性回復升高。
結論:
miR-32通
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