中華鳑鮍遺傳多樣性的ISSR分析.pdf

1、本文以中華鳑鮍(Rhodeus sinensis)為研究對象,利用ISSR分子標記技術,對中華鳑鮍3個自然群體(河北省磁縣東伍仕水庫群體、河南省安陽市彰武水庫群體和河南省信陽商城縣鲇魚山水庫群體)的遺傳多樣性進行分析,了解中華鳑鮍的遺傳多樣性水平和遺傳結構,為其分類地位的甄別和其資源保護提供新的資料和科學依據(jù)。主要研究結果如下:
　　 (1)經條件優(yōu)化,建立了中華鳑鮍ISSR-PCR最佳反應體系,10×Taq Buffer(Mg

2、2+)2.5μl、25mmol/L MgCl22μl、10mmol/L4×dNTP-mixture0.75μl、10mmol/L Primer1μl、5U/μl TaqDNA聚合酶0.15μl、50ng/μl模板1.5μl,最終加無菌的ddH2O至25μl。擴增程序為94℃預變性5min,然后進入38個循環(huán),即94℃變性40 sec,48℃-56℃(隨不同引物而定)退火40 sec,72℃延伸90 sec;最后72℃終延伸10min,4

3、℃保存。
　　 (2)篩選出12個引物,對中華鳑鮍3個群體共90尾中華鳑鮍基因組DNA進行ISSR-PCR擴增,共檢測到98個位點,多態(tài)位點73個,多態(tài)性比例為74.49％。利用POPGENE軟件分析3個中華鳑鮍群體的多態(tài)位點比例(PPB)、觀測等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei's基因多樣度(h)、Shannon's信息指數(shù)(I)和遺傳距離(D)分別在51.58％～054.26％、1.3367～1.4796、1

4、.2368～1.3893、0.17660～0.3318、0.1956～0.3016、0.1547～0.2217之間,各群體所有遺傳多樣性指標綜合顯示,中華鳑鮍3個群體的遺傳多樣性保持在一定水平,各居群間的遺傳多樣性水平依次為:安陽＞河北＞信陽。
　　 (3)利用POPGENE基于Nei's基因多樣性計算中華鳑鮍各居群間遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.4051,說明中華鯖皴各居群間存在強烈的遺傳分化。由Gst計算的種群間基因流(Nm)

5、為0.7344,基因流水平低。
　　 (4)根據(jù)Nei的公式計算群體間的無偏遺傳距離(D)和遺傳相似系數(shù)(S),結果顯示,河北群體與安陽群體遺傳距離最小為0.2033,河北群體與信陽群體遺傳距離最大為0.2995;信陽群體與河北群體遺傳相似系數(shù)最小為0.7412,安陽群體與河北群體遺傳相似系數(shù)最大為0.8160,表明河北群體與安陽群體親緣關系較近,河北群體與信陽群體親緣關系較遠。UPGMA聚類顯示,河北群體和安陽群體間的親緣關系