自噬相關(guān)IRGM基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群強(qiáng)直性脊柱炎易感性的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、目的：強(qiáng)直性脊柱炎（Ankylosing Spondylitis, AS）被證實(shí)與炎癥性腸道疾?。↖nflammatory Bowel Disease, IBD）具有相同的遺傳背景，而大量研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)免疫相關(guān)鳥苷三磷酸酶家族M（Immunity-related GTPase family M, IRGM）基因與IBD遺傳易感性有關(guān)聯(lián)。本文旨在探討IBD相關(guān)的IRGM基因多態(tài)性與中國(guó)AS易感性之間的關(guān)聯(lián)。
　　方法：本次研究共納入1

2、270例調(diào)查對(duì)象，其中AS組為643例來(lái)自于安徽醫(yī)科大學(xué)一附院風(fēng)濕科確診的患者，診斷標(biāo)準(zhǔn)按照1984年修訂的紐約標(biāo)準(zhǔn)；對(duì)照組則是性別、年齡及民族與AS組相匹配，來(lái)自于合肥市中心血站的627名無(wú)關(guān)聯(lián)的健康對(duì)照。共篩選 IRGM基因的2個(gè)標(biāo)簽（tag）SNP位點(diǎn)（rs10065172和rs4958846），并采用改進(jìn)的多重連接酶檢測(cè)技術(shù)（improved Multi-Ligase Detection Reaction, iMLDR）進(jìn)行基因

3、型分型。分析比較各位點(diǎn)在病例組和對(duì)照組之間基因型及等位基因頻率的分布情況，并采用Logistic回歸方法比較以下三種模型：顯性模型（CT+TT vs. CC）、隱性模型（TT vs. CT+CC）及共顯性模型（CT vs. TT vs. CC）在病例組和對(duì)照組之間的差異；此外，進(jìn)行連鎖不平衡（Linkage Disequilibrium, LD）分析并構(gòu)建單倍型，以進(jìn)一步獲取關(guān)聯(lián)信息；分析tag SNP基因型的分布情況與AS患者疾病功能

4、指數(shù)（Bath AS Functional Index, BASFI）以及疾病活動(dòng)度指數(shù)（Bath AS Disease Activity Index, BASDAI）之間的關(guān)聯(lián)；最后，分析 SNP位點(diǎn)不同基因型分布與 AS患者相關(guān)環(huán)境因素之間是否存在交互作用?；贏S發(fā)病存在性別差異的可能性，本次研究同時(shí)按照性別進(jìn)行了分層分析，旨在探討IRGM基因與AS發(fā)病是否存在性別特異性。定性資料的表示使用頻數(shù)（n,%），組間比較分析采用χ2檢驗(yàn)

5、；正態(tài)連續(xù)性資料使用Mean±SD表示，組間比較采用Student t檢驗(yàn)；而非正態(tài)連續(xù)性資料則采用Median（IQR）表示，組間比較采用Mann-Whitney U檢驗(yàn)；上述統(tǒng)計(jì)分析均使用Haploview4.2軟件及SPSS16.0軟件。檢驗(yàn)水準(zhǔn)設(shè)定為雙側(cè)0.05，多重比較使用Bonferroni法對(duì)P值進(jìn)行校正。
　　結(jié)果：643例AS患者平均年齡為28.2±8.9歲，其中男性患者527（82.0%）人，女性患者116（1

6、8.0%）人；627健康對(duì)照平均年齡為27.8±7.6歲，其中男性患者515（82.1%）人，女性患者112（17.9%）人；病例組和對(duì)照組在性別(χ2=0.007, P=0.934)和年齡(t=?0.882, P=0.378)方面的差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性意義。AS患者的BMI為21.6±3.6 Kg/m2，HLA-B27陽(yáng)性率為93.6%，總病程為2.8（0.5,6.0）年，ESR為11.0（2.0,25.0）mm/h，CRP為6.8（

7、1.1,23.7）mg/L，BASFI得分為0.9（0.0,2.4）cm，BASDAI得分為1.8（0.4,3.3）cm。對(duì)照組中兩個(gè)tag SNP位點(diǎn)均符合哈迪-溫伯格遺傳平衡（rs10065172：P=0.180；rs4958846：P=0.893）。對(duì)病例組與對(duì)照組之間基因型和等位基因型的分析均未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的關(guān)聯(lián)（P>0.05 for both）；進(jìn)一步按性別進(jìn)行分層分析后發(fā)現(xiàn)，基因型和等位基因頻率在女性患者組與相應(yīng)對(duì)照組間

8、的分布差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性意義（χ2=6.049, P=0.049;χ2=4.626, P=0.031），但這種差異在進(jìn)行Bonferroni校正后并不具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(校正后的顯著性水平α=0.05/2=0.025)?；蛐头治龅慕Y(jié)果發(fā)現(xiàn)，在女性AS患者與女性健康對(duì)照間，顯性模型（CT+TT vs. CC: OR0.514,95% CI0.301-0.876, P=0.014）與共顯性模型（CT vs. CC:OR0.518,95%CI

9、0.297-0.902, P=0.020)）均存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的顯著性差異；此外，經(jīng)Bonferroni法校正后，上述的差異仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（校正后的顯著性水平α=0.05/2=0.025）；而在男性人群及總體人群分析中，Bonferroni法校正前后均未發(fā)現(xiàn)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的關(guān)聯(lián)。LD檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn) rs10065172和 rs4958846間存在較強(qiáng)連鎖不平衡（D’=1, r2=0.433）；單倍型分析的結(jié)果發(fā)現(xiàn)單倍型rs4958846C

10、-rs10065172C在病例組與對(duì)照組間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的顯著性（H3:OR=1.316,95%CI1.084-1.598, P=0.0055）；按性別進(jìn)行亞組分析顯示，rs4958846C-rs10065172C只在女性病例組和對(duì)照組間存在顯著性差異（OR=2.093,95%CI1.301-3.368, P=0.0021），在男性AS患者與男性健康對(duì)照間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。臨床特征分析發(fā)現(xiàn)AS患者的病程、ESR、CRP、BASFI

11、及BASDAI在三種基因型之間的分布均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異；此外按性別進(jìn)行分層分析后也未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義上的關(guān)聯(lián)。單因素 logistic回歸分析結(jié)果顯示：在rs4958846位點(diǎn)隱性模型條件下，每日膳食中蔬菜攝入量可能是中國(guó)漢族人群 AS發(fā)病的易感因素(OR=4.895,95%CI1.011-23.709, P=0.048)，但多因素 logistic回歸分析并未發(fā)現(xiàn)任何有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的結(jié)果，這表明IRGM基因與各環(huán)境變量并不具有交互效應(yīng)。