水稻氮代謝基因的核苷酸多樣性及其與產(chǎn)量性狀的關聯(lián)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、分類號華中農(nóng)業(yè)大學博士學位論文水稻氮代謝基因的核昔酸多樣性及其與產(chǎn)量性狀的關聯(lián)分析Nucleotidediversityofnitrogenmetabolismgenesanditsassoeiationwithyield一relatedtraitsinriee博士研究生:丁澤紅指導教師:余四斌教授指導小組:余四斌教授牟同敏教授曾漢來教授何予卿教授崔克輝教授專業(yè):作物生物技術獲得學位名稱:農(nóng)學博士研究方向:水稻分子生物學獲得學位時間:2

2、011年6月華中農(nóng)業(yè)大學植物科學技術學院二O一一年六月華中農(nóng)業(yè)少、學2011屁博U十究生學位論文1.6.1核心種質(zhì)概念的提出........................................................................……221.6.2核心種質(zhì)的特點_.…,…、.,.…、..……,._……,............……,.……,、..…,.…,.,,.…,221.6.3水稻核心種質(zhì)研究進

3、展.....……、.................................................……,.……231.7單核普酸多樣性與選擇、進化....................................................……,........……241.7.1單核營酸多樣性概述.........................................................

4、................……241.7.2DNA鋇l序技術的發(fā)展.........................................................................……251.72.1Sanger法測序..……,..…,甲................……,..............……,........……,.…251.7,2.2Roche公司454測序技術..........

5、...............................................……261.7.2.3llumina公司Solexa測序技術二,二,…,...……,…,,.......................……271.7.2.4ABI公司SOLID測序技術.......................................................……281.7.2.5HehcoS公司單分子測序技

6、術....................................……,........……291.7.2.6PacificBiosciences公司單分子實時測序技術................……,.……30L7.2.7OxfdNanope公司納米孔單分子測序技術.......................……301.7.3檢測選擇作用的一般方法.....................................

7、............................……311.7.3.1基于種內(nèi)多態(tài)性的中性檢測...................................................……311.7.3.1.1Tajima’sD檢驗................................................................……311.7.3.12Fu和Li的D和F檢驗......…

8、…甲...................................……321,7.3.1.3Fay和Wu的H檢驗.......................................................……321.7.3.2基于種間多態(tài)性的中性檢驗.......……,...................................……,.321.7.3.2.1McD0nald和Kreitman(MK)檢

9、驗..............……,.........……321.7.3.2.2Hudson一Kreitman一Aquade(HKA)檢驗..............……,..……331.7.3.2.3K留KS檢驗......................................................................……331.7.3.3基于單倍型比較的檢驗方法....................

10、...............................……331.7.3.3.1LongRangeHaplotypes(LRH)檢驗...........................……341.7.3.3,2iHHSce(iHS)檢驗...................................................……341.7.3.3.3LinkageDisequilibrinmDecay(LDD)檢驗

11、.................……341.74一些受到選擇作用的基因......……,....................................................……341.8植物關聯(lián)分析研究進展..........……,............................……,..........................……361.8.1連鎖不平衡(LD)的度量及其影響因素.........

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