2023年全國碩士研究生考試考研英語一試題真題(含答案詳解+作文范文)_第1頁
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文檔簡介

1、目的:
  通過mRNA和lncRNA的基因芯片,分析內(nèi)皮細胞在microRNA let-7e影響下的mRNA和lncRNA差異表達情況;運用生物信息學(xué)的相關(guān)方法,尋找顯著差異表達的mRNA和lncRNA,利用mRNA功能聚類分析找出差異lncRNA的共表達基因?qū)ΓA(yù)測共表達的lncRNA的生物學(xué)功能以及參與的信號通路,構(gòu)建lncRNA-let-7e-mRNA相互作用網(wǎng)絡(luò);為探討let-7e在內(nèi)皮細胞中的作用奠定基礎(chǔ)。
  

2、材料和方法:
  1.培養(yǎng)人臍靜脈內(nèi)皮細胞,分為6組轉(zhuǎn)染1et-7e mimic、inhibitor和陰性對照,提取總RNA。通過mRNA和lncRNA芯片,檢測和分析轉(zhuǎn)染let-7e的內(nèi)皮細胞mRNA和lncRNA表達譜,運用倍數(shù)法篩選出let-7e mimic和inhibitor與陰性對照組比較存在的差異表達lncRNA和mRNA,并使用t檢驗的方法控制假陽性率。
  2.針對差異性表達的mRNA,應(yīng)用DAVID和WEB

3、-based Gene Set Analysis Toolkit,得到mRNA的功能和生物學(xué)信號通路,進行基因功能聚類分析;利用pearson相關(guān)系數(shù)預(yù)測差異表達的lncRNA的共表達基因及其功能;根據(jù)相互作用關(guān)系構(gòu)建lncRNA-let-7e-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
  結(jié)果:
  1.lncRNA芯片差異分析結(jié)果顯示,inhibitor組和陰性對照比較存在1126個顯著差異lncRNA分子,有942個差異的mRNA分子;mi

4、mic組和陰性對照比較存在819個顯著差異lncRNA分子;有621個差異的mRNA分子。
  2.通過共表達聚類分析和mRNA功能聚類分析,得到mRNA-lncRNA共表達對,并找到7個let-7e結(jié)合位點,發(fā)現(xiàn)let-7e對內(nèi)皮細胞的調(diào)控通路。
  結(jié)論:
  在本研究中,我們發(fā)現(xiàn)let-7e與內(nèi)皮細胞的很多生物學(xué)過程密切相關(guān),如免疫炎癥反應(yīng)、增殖、凋亡和脂質(zhì)代謝等。通過進一步構(gòu)建lncRNA-let-7e-mRN

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