基于文獻(xiàn)挖掘的結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)聯(lián)分析方法研究與應(yīng)用.pdf

1、隨著醫(yī)療科技的發(fā)展，大規(guī)模生物數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)以及基因測(cè)序能力的大幅提升，產(chǎn)生了海量的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)。在積累生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的同時(shí)，也積累了大量的非結(jié)構(gòu)化文獻(xiàn)數(shù)據(jù)。對(duì)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析，從中提煉出更多的生物醫(yī)學(xué)信息，有助于了解疾病發(fā)生發(fā)展的機(jī)制和過(guò)程，促進(jìn)疾病的診治。傳統(tǒng)的手工分析和注釋的方法已經(jīng)難以適應(yīng)快速的文獻(xiàn)增長(zhǎng)，國(guó)內(nèi)外已經(jīng)有越來(lái)越多研究者關(guān)注文獻(xiàn)挖掘方法的研究。現(xiàn)有方法多是基于“共現(xiàn)”原則，結(jié)合自然語(yǔ)言處理的方法進(jìn)行語(yǔ)義分析和語(yǔ)法處理，

2、一定程度上限制“潛在”關(guān)系挖掘和待分析文章數(shù)量。且研究對(duì)象主要集中在疾病層次，目前還沒(méi)有比較權(quán)威的針對(duì)一種特定的腫瘤疾病，綜合現(xiàn)有文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，挖掘疾病相關(guān)臨床術(shù)語(yǔ)與基因潛在關(guān)系的研究。
　　因此，本論文提出一種潛在關(guān)聯(lián)分析的文獻(xiàn)挖掘方法。并針對(duì)典型腫瘤疾病結(jié)直腸癌，以促進(jìn)腫瘤精準(zhǔn)防治為目標(biāo)，將方法應(yīng)用到結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘中，并結(jié)合生物醫(yī)學(xué)知識(shí)，對(duì)挖掘結(jié)果進(jìn)行深入探究和分析。具體工作如下:
　　提出一種基于MeSH主題詞

3、的文獻(xiàn)挖掘方法，能夠?qū)?fù)雜的關(guān)聯(lián)分析轉(zhuǎn)化為矢量間的數(shù)學(xué)運(yùn)算，實(shí)現(xiàn)定量分析，同時(shí)避免“共現(xiàn)”原則帶來(lái)的限制，為潛在關(guān)系挖掘提供一種新的思路;
　　選取結(jié)直腸癌為研究對(duì)象，將本文提出方法應(yīng)用于結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)關(guān)系挖掘。并結(jié)合組學(xué)分析工具等，對(duì)挖掘得到的結(jié)果進(jìn)行分析和解釋。提出MTA1-perineuralinvasion（嗜神經(jīng)性侵襲，腫瘤惡化標(biāo)志）等潛在臨床-組學(xué)關(guān)系，為結(jié)直腸癌基礎(chǔ)研究提供參考;
　　構(gòu)建結(jié)直腸癌臨床-組學(xué)