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文檔簡介
1、第一部分:[目的]證明豬IDO基因的存在,分析并克隆豬IDO基因的編碼序列,明確其生物信息學結構特點及表達分布特點。
[方法]運用生物信息學方法從GenBank獲得與人IDO基因同源的豬EST序列,通過電子克隆得到預測序列,再經比對得相似度高的豬mRNA序列,然后通過RT-PCR技術在豬血管內皮細胞系PED中驗證該序列的準確性,對該序列進行生物信息學分析,并在核酸水平研究其組織表達分布特點。應用體細胞雜交板(somatic
2、 cell hybrid panel,SCHP)技術對豬IDO基因進行染色體定位分析。以已公布的人IDO同源蛋白的三級結構為模板,利用生物信息學軟件及相關數據庫構建豬IDO蛋白的三維空間結構模型。
[結果]通過分子克隆、測序、同源性分析,證實豬存在IDO基因,將結果提交至GenBank,獲得登錄號為HM209418。豬IDO基因在豬的胸腺、肺、附睪和眼底中有基礎水平的表達,尤其在豬外周血單核/巨噬細胞中表達豐富,IFN-γ
3、刺激后豬血管內皮細胞上可表達IDO。
[結論]生物信息學方法指導分子生物學實驗,有助于新基因的預測、發(fā)現(xiàn)與鑒定。本研究確證了豬存在IDO基因的推測,明確了該基因相關的分子結構信息,為研究豬IDO蛋白的免疫學功能奠定了基礎。
第二部分:[目的]分別構建高水平表達天然poIDO分子和帶標簽蛋白的poIDO融合蛋白的重組表達載體。
[方法]利用RT-PCR擴增豬IDO基因編碼區(qū)片段,連接至T載體,經測
4、序驗證無誤后,分別亞克隆至真核表達載體pcDNA 3.1(-)和pCMV-Tag2B,構建重組質粒。將重組質粒和空載體分別轉染至CHO細胞和PED細胞,用G418進行篩選;通過Western Blot、免疫化學和免疫熒光等方法檢測,鑒定出能穩(wěn)定表達pcDNA 3.1(-)-poIDO、 pcDNA 3.1(-)的PED細胞亞群和能穩(wěn)定表達pCMV-Tag2B-poIDO和pCMV-Tag2B的CHO細胞亞群。
[結果]經過
5、雙酶切和測序鑒定,重組質粒pcDNA 3.1(-)-poIDO與pCMV-Tag2B-poIDO構建成功。
[結論]成功構建出能表達天然豬IDO分子的載體質粒pcDNA 3.1(-)-poIDO和能表達出融合蛋白pCMV-Tag2B-poIDO,該蛋白可作為豬IDO介導人血清殺傷豬血管內皮細胞作用研究的重要工具。
第三部分:[目的]研究豬IDO在人血清對豬內皮細胞殺傷效果中的作用,并進一步研究其在這一過程中的
6、作用機制。
[方法]利用流式細胞術檢測IDO特異性阻斷劑1-MT對人血清對PED殺傷效果的影響,由此初步判斷IDO對人血清殺傷豬血管內皮細胞的影響。建立用PI單染法檢測人血清對豬血管內皮細胞系(SV-40-PED)細胞毒作用的方法。
[結果]人血清對豬血管內皮細胞的殺傷作用顯著;在加入1-MT后,人血清對豬血管內皮細胞的殺傷效果受到抑制。
[結論] IDO促進人血清對豬血管內皮細胞的殺傷作用;P
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