法醫(yī)學(xué)常用15個(gè)STRs的檢測(cè)及其應(yīng)用于人群遺傳關(guān)系推斷的研究.pdf

1、背景和目的:
　　 短串聯(lián)重復(fù)序列一般是由兩個(gè)或多個(gè)核苷酸為核心序列的重復(fù)出現(xiàn)而組成的串聯(lián)結(jié)構(gòu),以重復(fù)區(qū)域?yàn)橹行牡钠伍L(zhǎng)度一般在400bp以內(nèi),重復(fù)單位為2～6bp,重復(fù)次數(shù)可達(dá)10～60次。由于不同STRs位點(diǎn)的核心序列不同,而同一STR位點(diǎn)在不同人中的重復(fù)次數(shù)不同,導(dǎo)致出現(xiàn)個(gè)體差異,構(gòu)成了長(zhǎng)度多態(tài)性,廣泛應(yīng)用于個(gè)體識(shí)別和親權(quán)鑒定。由于STRs具有分布廣、信息量大、高度多態(tài)性以及遵循孟德?tīng)柟诧@性遺傳等特點(diǎn),也成為推斷民族遺傳距

2、離的有效工具。
　　 哈薩克族是哈薩克斯坦的主要民族和中國(guó)的少數(shù)民族,人口1700萬(wàn)。在中國(guó)主要分布于新疆維吾爾自治區(qū)伊犁哈薩克自治州、木壘哈薩克自治縣、巴里坤哈薩克自治縣、甘肅省阿克塞哈薩克族自治縣。該民族使用文字是以阿拉伯字母為基礎(chǔ)的哈薩克語(yǔ),按語(yǔ)言系屬分類(lèi),屬于突厥語(yǔ)族人種。按血統(tǒng)分類(lèi),屬于蒙古人種北亞類(lèi)型和歐羅巴人種及印度地中海類(lèi)型之間的混合類(lèi)型,屬于混血民族。
　　 由于部分哈薩克人仍以游牧生活為主,無(wú)固定居住

3、區(qū)域,且地理位置較為偏僻,交通不便,經(jīng)濟(jì)發(fā)展欠發(fā)達(dá)等多重原因,我國(guó)哈薩克族人群的15個(gè)基因座數(shù)據(jù)資料至2011年10月一直未見(jiàn)報(bào)道。因?qū)熃M有機(jī)會(huì)從新疆合作單位取得新疆哈薩克族血樣,特對(duì)這些血樣進(jìn)行法醫(yī)學(xué)常用STR基因座的檢測(cè)。
　　 然后,本研究通過(guò)公用數(shù)據(jù)庫(kù)或同行評(píng)議期刊等網(wǎng)絡(luò)資料庫(kù),收集了中國(guó)各個(gè)省份、其它各個(gè)民族的STR基因座頻率數(shù)據(jù)。通過(guò)對(duì)40個(gè)不同民族群體間遺傳距離的計(jì)算,構(gòu)建了多個(gè)民族間的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),以探討其遺傳關(guān)

4、系。
　　 方法:
　　 使用酚-氯仿法對(duì)100例新疆哈薩克族外周血樣進(jìn)行DNA提取,使用Identifiler試劑盒進(jìn)行熒光標(biāo)記PCR擴(kuò)增,而后使用3130DNA測(cè)序儀對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳,最后完成對(duì)新疆哈薩克族100例健康無(wú)親緣性個(gè)體的15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性的研究。
　　 通過(guò)公用數(shù)據(jù)庫(kù)或同行評(píng)議期刊等資料庫(kù)收集中國(guó)各個(gè)省份、各個(gè)民族其它群體的STR基因座頻率數(shù)據(jù);將獲得的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)與新疆哈薩克族的

5、遺傳數(shù)據(jù),篩選匯總后計(jì)算出9個(gè)法醫(yī)學(xué)常用STR位點(diǎn)(D13S317、D18S51、D21S11、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、FGA、vWA)在中國(guó)40個(gè)民族中的基因頻率,以phylip3.69統(tǒng)計(jì)軟件包計(jì)算遺傳距離,并通過(guò)Neighbor-joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹(shù),研究各民族間的遺傳關(guān)系。
　　 結(jié)果:
　　 對(duì)100例新疆哈薩克族的15個(gè)STR基因座進(jìn)行檢測(cè)分別檢出了10、15、8

6、、10、6、6、7、6、12、11、8、6、12、7、10個(gè)等位基因,其基因頻率分布范圍分別在0.01～0.25,0.005～0.275,0.01～0.225,0.015～0.33,0.01～0.335,0.01～0.285,0.015～0.24,0.025～0.265,0.015～0.205,0.015～0.29,0.02～0.26,0.01～0.595,0.005～0.255,0.025～0.365以及0.005～0.205之間。<

7、br>　　 比較所有40個(gè)族群的9個(gè)STRs基因座基因頻率數(shù)據(jù)計(jì)算出了遺傳距離,并根據(jù)遺傳距離采用Neiglabor-joining法構(gòu)建了40個(gè)族群之間的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)。在樹(shù)狀圖上,可以看出在系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的下半部分,新疆維吾爾族先與內(nèi)蒙古蒙古族首先聚合,然后再與新疆哈薩克族、內(nèi)蒙古達(dá)斡爾族、天津漢族,青?；刈宸謩e聚合,繼而與青海藏族、西藏藏族、西藏珞巴族,浙江畬族的亞類(lèi)相聚合,再與陜西漢族、云南白族,天津朝鮮族、湖南土家族、山東漢族、江蘇

8、漢族相聚合。然后與河北漢族、內(nèi)蒙古漢族、河南漢族,遼寧漢族形成的漢族亞類(lèi)相聚合,構(gòu)成了整個(gè)北方人群。系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)上半部分,廣西毛南族和廣西京族首先聚合,繼而與廣西苗族、廣西仫佬族聚合,與廣西瑤族和海南黎族聚合的亞類(lèi)聚合。接下來(lái)與廣西瑤族、海南漢族相聚合。廣西侗族、廣西壯族。廣西漢族、廣東漢族的亞類(lèi)與之相聚合后,又與四川漢族、福建漢族以及湖北漢族以及重慶土家族聚合,構(gòu)成南方人群。而安徽漢族、浙江漢族,構(gòu)成了南方漢族和北方漢族之間的過(guò)渡人群。