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文檔簡介
1、隨著計算機科學的發(fā)展,應用量子力學進行模擬計算廣泛應用于科學研究的方方面面。隨著研究的不斷深入,人們對于計算機的硬件要求越來越高。為了提高計算效率,發(fā)展了以經典力學為基礎的非量子法模擬方案,這主要包括分子力學方法,分子動力學方法,蒙特卡洛方法,布朗動力學方法和耗散粒子動力學方法等。近幾年來,粗粒化計算機模擬得到了很大發(fā)展,粗粒化模型簡化了分子結構,使得模擬計算的自由度數(shù)目減少,進而提高了計算效率。但是,進行粗粒化分子力學/分子動力學模擬
2、需要特定的力場,目前還沒有一個通用的粗粒化力場可供使用。本論文依據(jù)石油組分中烴類化合物的結構定義粗?;Y構單元,構建石油中烴類組分的粗?;肿恿W/分子動力學力場。
分子力學,在各項勢能函數(shù)的約束下,調整體系內分子的結構形態(tài)和位移,得到體系能量最低構象,即為體系的最穩(wěn)定狀態(tài)。勢能函數(shù)主要包括非鍵勢能、鍵伸縮勢能、鍵角彎曲勢能、二面角扭曲勢能、偏離平面振動勢能、庫倫靜電勢能等。本論文通過進行相應體系的全原子模擬數(shù)據(jù)擬合上述勢
3、能函數(shù)的表達式,得到相應的粗?;鰠?shù),這是建立粗粒化力場的關鍵之一。
分子動力學,主要應用牛頓運動方程,計算得到每個粒子的位置坐標和動量,再通過統(tǒng)計計算的方法得到整個體系的動態(tài)特征,進而得到整個體系的宏觀性質。本論文依據(jù)Verlet算法對牛頓運動方程進行積分的原理,應用Materials Studio軟件中Forcite模塊進行分子動力學模擬計算。
構建粗?;?本論文將石油中烴類組分劃分為烷烴、烯烴、
4、芳香烴和環(huán)烷烴四類,統(tǒng)計石油組分中常見的烴類分子結構,以最少的個數(shù)構建可以覆蓋全部烴類組分的粗?;Y構單元。針對不同的粗粒化模型,尋找與該粗?;P徒Y構相似的模型化合物進行全原子分子力學/分子動力學模擬,得到相應的徑向分布函數(shù)后,應用波爾茲曼反轉的方案得到相應的力場參數(shù)。應用構建的粗?;鲞M行粗?;肿恿W/分子動力學模擬,分析計算粗?;w系的密度、混合自由能等相關熱力學參數(shù),粗?;M值與實驗值、全原子模擬值相近,進而驗證孑本論文所
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