版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進(jìn)行舉報或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡介
1、多聚腺苷化[poly(A)]是真核生物基因表達(dá)的一個重要步驟,對mRNA從細(xì)胞核輸出及翻譯過程起重要作用。Poly(A)位點(diǎn)的有效剪切、轉(zhuǎn)錄終止及翻譯終止都跟poly(A)信號(PAS)密切相關(guān)。研究表明一些poly(A)信號上的堿基突變能夠影響poly(A)位點(diǎn)的選擇,即單核苷酸多態(tài)性(SNP)能改變或產(chǎn)生poly(A)信號,從而導(dǎo)致poly(A)位點(diǎn)的差異性選擇。作為第三代遺傳標(biāo)記,SNPs會引發(fā)人類的一些常見疾病,被廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)
2、研究和生物的諸多領(lǐng)域。在擬南芥中,“1001基因組計(jì)劃”所產(chǎn)生的不同生態(tài)型全基因組序列及海量SNPs數(shù)據(jù),為從全基因組水平提取影響多聚腺苷化效能的SNPs提供了契機(jī)。
本文提出了從全基因組提取影響多聚腺苷化效能的SNPs的方法——ESAP(extract SNPs associated with polyadenylation),分析了SNPs對poly(A)信號的不同改變形式,篩選能改變PAS的SNPs,并使用基于廣義隱馬爾
3、可夫模型的poly(A)位點(diǎn)預(yù)測方法定量表示被SNPs影響的PAS對poly(A)位點(diǎn)效能的影響,最后根據(jù)預(yù)測的poly(A)效能分值將SNPs分為“會影響”、“可能會影響”、“不影響”。
本文使用ESAP方法分析了擬南芥全基因組SNPs和poly(A)位點(diǎn)數(shù)據(jù),提取了160個能影響PAS的SNPs,其中84個和38個SNPs分別被歸為“會影響”和“可能會影響”多聚腺苷化效能。只有0.021%的SNPs被歸類為“會影響”和“可
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預(yù)覽,若沒有圖紙預(yù)覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 蚜蟲基因組dna提取方法的改進(jìn)
- 全基因組關(guān)聯(lián)研究中的多水平模型.pdf
- 單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增聯(lián)合比較基因組雜交方法的建立及初步研究.pdf
- 高溫誘導(dǎo)對羅非魚全基因組甲基化水平的影響研究.pdf
- 植物基因組dna提取步驟
- 利用隨機(jī)過程考察全基因組選擇方法的選擇效果.pdf
- 苯亞慢性吸入對小鼠骨髓全基因組甲基化的影響.pdf
- 基于阿貝爾復(fù)雜度方法的全基因組DNA甲基化的預(yù)測.pdf
- 動物基因組dna提取方法研究進(jìn)展【文獻(xiàn)綜述】
- 云南宣威肺癌全基因組DNA甲基化.pdf
- 浙貝母基因組dna提取方法比較研究【開題報告】
- 微生物全基因組范圍內(nèi)的最小基因組研究進(jìn)展
- 基于基因組全序列的分子系統(tǒng)學(xué)方法研究.pdf
- HBV相關(guān)肝病的全基因組關(guān)聯(lián)研究.pdf
- 基于全基因組的DNA序列詞語挖掘.pdf
- 膽道癌全基因組雜交分析的研究.pdf
- 基于EST全基因組定位的基因結(jié)構(gòu)注釋研究.pdf
- 玉米全基因組ARF基因的分析及進(jìn)化研究.pdf
- 楊樹全基因組WRKY基因的鑒定及表達(dá)分析.pdf
- 玉米全基因組IQD基因的分析及進(jìn)化研究.pdf
評論
0/150
提交評論