四川骨髓庫漢族人群MICA等位基因分布.pdf

1、目的:
　　 研究中國造血干細(xì)胞捐獻(xiàn)者資料庫(CMDP)四川分庫中四川籍漢族人群MICA等位基因分布特點及其與HLA組成的單倍型特點。并初步估計四川造血干細(xì)胞移植供受者之間可能存在的MICA位點錯配情況。
　　 方法:
　　 從四川骨髓庫2008年12月-2009年11月街頭采集的600余份川籍漢族無關(guān)志愿者樣本中,隨機(jī)選擇119(人)份,這些樣本均已完成HLA-A/B/DRB1高分辨分型；從四川省臍帶血造血干細(xì)

2、胞庫HLA臨床檢測室選取10例已完成HLA-A/B/DRB1低分辨分型,等待造血干細(xì)胞移植治療的血液病患者標(biāo)本。分別采用PCR—SBT和PCR—SSP技術(shù),對MICA基因第2—6外顯子測序分型和MICA基因缺失型(MICA*Del)檢測。應(yīng)用直接計數(shù)法計算MICA各等位基因頻率；應(yīng)用卡方檢驗比較MICA等位基因在不同人群中的分布差異；應(yīng)用ARLEQUIN3.5.1.2軟件對該群體HLA-B/MICA2位點連鎖不平衡分析和單倍型頻率計算以

3、及HLA-A/B/MICA/HLA-DRB14位點單倍型頻率計算。
　　 結(jié)果:
　　 共檢測到13種已知MICA等位基因和2種新的MICA等位基因。其中以MICA*010(25.2％)最常見,其次為MICA*F008:01/04(23.1％),MICA*002:01(16.0％),MICA*019(10.5％),MICA*012:01(8.8％),MICA*049(4.2％)和MICA*009:01(3.8％),這7種

4、等位基因占所檢出MICA等位基因的91.6％。與浙江漢族相比,僅MICA*027分布存在統(tǒng)計學(xué)差異,與內(nèi)蒙古漢族、韓國人、美國白人及非洲裔美國人相比,有5—11種不同MICA等位基因分布存在統(tǒng)計學(xué)差異。四川骨髓庫漢族與上述5個群體間總體分布均存在統(tǒng)計學(xué)差異。本研究發(fā)現(xiàn)3例2種新的MICA等位基因,被世界衛(wèi)生組織HLA因子命名委員會分別命名為MICA*064N和MICA*010:02。與MICA*064N序列最為相似的是MICA*027,

5、二者僅存在801位G>A堿基取代,導(dǎo)致編碼胞外α3結(jié)構(gòu)域的244位密碼子由色氨酸(UGG)密碼子變成了終止密碼子(UGA)；與MICA*010:02序列最為相似的是MICA*010,二者僅存在933位T>C堿基取代,該堿基突變?yōu)橥x突變。連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn),四川骨髓庫漢族人群中B*1301-MICA*045,B*4801-MICA*Del緊密連鎖；A*0207-B*4601-MICA*010-DRB1*0901為最常見的4位點單倍型。對