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文檔簡介
1、研究背景與目的:我國是乙型肝炎與肝癌的高發(fā)區(qū)。乙型肝炎病毒(HBV)X基因及其編碼的多功能蛋白HBx是乙型肝炎病毒基因轉錄的必須因子,與乙型肝炎和肝細胞癌的發(fā)生關系十分密切。本研究通過寡核苷酸基因芯片技術和生物信息學分析確定了HBxAg反式激活作用的新型靶基因,即乙型肝炎病毒X蛋白反式調(diào)節(jié)基因11(XTP11)。本研究在探討XTP11的生物學功能過程中,發(fā)現(xiàn)XTP11的剪切體;通過生物信息學分析、亞細胞定位、原核表達幾個方面初步闡釋該基
2、因剪切體在HBV發(fā)病過程中的生物學作用。 方法: (1)根據(jù)XTP11的全長編碼基因,設計克隆擴增得到XTP11剪切體,對剪切體進行生物信息學分析。 (2)構建重組綠色熒光表達載體pEGFP-C1-XTP11剪切體,轉染人肝母細胞瘤細胞系HepG2,轉染24hr后在熒光倒置顯微鏡下觀察。 (3)構建重組的原核表達載體pET-32a(+)-XTP11剪切體轉化BL21宿主菌后,重組蛋白經(jīng)IPTG誘導,獲得了
3、帶有組氨酸(His-)標簽的重組融合蛋白的優(yōu)化表達,并用SDS-PAGE和Western blot對表達蛋白的特異性進行分析和驗證;利用Ni+親和柱純化表達蛋白。 結果: (1)利用NCBI數(shù)據(jù)庫中BLASTn比對分析XTP11基因,根據(jù)基因起始密碼子的Kozak規(guī)則和終止密碼子下游保守的多聚腺苷酸信號序列,電子拼接推定該基因的開放讀碼框架,獲得相應的XTP11剪切體全長編碼基因。在NCBI中登陸獲取基因庫登錄號(FJ2
4、11061)。研究發(fā)現(xiàn)XTP11剪切體(1314bp)比XTP11(1344bp)少了GGGDFGGGDF 10個氨基酸殘基,其余序列相同。 (2)HepG2細胞漿出現(xiàn)均勻綠色熒光信號,提示XTP11剪切體主要定位于細胞漿內(nèi)。 (3)XTP11剪切體融合蛋白在原核表達系統(tǒng)成功表達。SDS-PAGE分析表明其以包涵體形式存在,Western blot檢測目的基因表達蛋白的特異性,成功獲得了融合蛋白純品。 結論:本研
5、究利用ProtParam軟件的分析,發(fā)現(xiàn)了XTP11剪切體蛋白的不穩(wěn)定系數(shù)、疏水性指數(shù)和總平均親水性。該蛋白主要有轉角和折疊組成,較少涉及螺旋和無規(guī)卷曲。該蛋白質(zhì)疏水性值的變化范圍為:-0.322-2.267; Signa1P3.0-信號肽預測工具分析錨定蛋白概率為0.195,提示該蛋白為非分泌蛋白。亞細胞定位證實XTP11剪切體基因定位于肝細胞漿內(nèi)。本研究成功利用大腸桿菌原核表達系統(tǒng)對基因進行了誘導表達,融合蛋白通過親和層析技術進行了
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