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文檔簡介
1、目的:
應用microRNAs(miRNAs)芯片篩選早孕小鼠胚胎著床前后子宮內(nèi)膜差異表達miRNAs,進行實時熒光定量PCR驗證,運用靶基因預測數(shù)據(jù)庫預測差異表達miRNAs調(diào)控的靶基因,為研究其在早孕小鼠胚胎著床過程中的作用打下基礎;通過數(shù)據(jù)庫的篩選,對靶基因指向與胚胎著床子宮內(nèi)膜增殖相關的miR-106b在早孕小鼠胚胎著床前后子宮內(nèi)膜表達規(guī)律進行研究,為研究miR-106b在胚胎著床過程中對子宮內(nèi)膜的作用機制打下基礎
2、。
方法:
1.樣本的準備:分別收集孕4天和孕6天的小鼠子宮內(nèi)膜組織。
2.miRNAs芯片分析:提取小鼠子宮內(nèi)膜組織的總RNA,總RNA用miRCURYTM LNA Array labeling kit(Exiqon,Denmark)使用Cy3按照說明書標記。Cy3標記的RNA用miRCURYTM LNA Arrays(Exiqon,Denmark)進行雜交。通過Gene Pix4000B掃描
3、儀和Gene Pix6.0軟件(Axon Instruments,Union City,CA)進行圖像掃描和數(shù)據(jù)分析。
3.熒光定量PCR檢測部分差異表達miRNAs:根據(jù)miRNA成熟序列設計特異性的反轉(zhuǎn)錄引物進行反轉(zhuǎn)錄,設計miRNAPCR.上下游引物進行實時熒光定量PCR,采用U6作為內(nèi)參,進行歸一化。
4.生物信息學分析:應用目前常用miRNAs靶基因預測網(wǎng)站Targetscan、Pictar、miR
4、Base來檢索差異表達miRNAs的預測靶基因。
5.原位雜交:原位雜交檢測miR-106b在胚胎著床前后子宮內(nèi)膜的表達量和表達部位。
結(jié)果:
1.miRNAs芯片結(jié)果顯示:孕6天比孕4天上調(diào)2倍及以上的miRNAs有17個;下調(diào)2倍及以上miRNAs有18個。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示芯片數(shù)據(jù)可靠。通過Targetscan、Pictar、miRBase等數(shù)據(jù)庫篩查,初步獲得差異表達的部分miR
5、NAs多指向與增殖、凋亡和抗凋亡相關的靶基因。
2.miRNAs芯片、實時熒光定量PCR和原位雜交顯示:miR-106b在孕4天的表達高于孕6天2倍以上,且主要表達在小鼠子宮內(nèi)膜基質(zhì)細胞,在腔上皮細胞和腺上皮細胞沒有表達。提示miR-106b可能通過調(diào)控其靶基因而調(diào)控早期妊娠子宮內(nèi)膜基質(zhì)細胞的生長、增殖、分化和凋亡。
結(jié)論:
1.本研究結(jié)果顯示孕6天與孕4天相比,存在差異表達的miRNAs,提示
6、miRNAs可能在胚胎著床前后子宮內(nèi)膜中起重要的調(diào)控作用。
2.利用實時熒光定量PCR.進一步驗證了部分差異表達的miRNAs,對這些miRNAs在孕6天和孕4天子宮內(nèi)膜組織的表達量進行定量檢測,驗證了miRNAs芯片結(jié)果的可靠性。
3.利用生物信息學方法,預測差異表達的miRNAs的靶基因,推測這些miRNAs可能通過調(diào)節(jié)增殖、凋亡和抗凋亡相關的靶基因來調(diào)控胚胎著床。
4.實時熒光定量PCR檢
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