應(yīng)用系統(tǒng)進(jìn)化樹分析維持性血液透析患者丙型肝炎病毒感染基因分型及同源性.pdf

1、目的：研究深圳市第二人民醫(yī)院血透中心維持性血液透析(MHD)患者丙型肝炎病毒(HCV)感染的基因型及同源性,結(jié)合臨床流行病學(xué)資料,為血液透析中心HCV感染的防治提供依據(jù)。
　　方法：熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)法測定抗-HCV陽性的MHD患者的HCV-RNA定量,對HCV-RNA定量≥1×103IU/mL的MHD患者,通過巢氏反轉(zhuǎn)錄(RT)-PCR對5’UTR及NS5B區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物通過SequenceScannerv1.

2、0導(dǎo)出峰圖,Muscle進(jìn)行序列比對,MEGA5.1構(gòu)建進(jìn)化樹以確定基因分型,bootstrap1000檢驗(yàn)進(jìn)化樹可靠性,Blat進(jìn)行序列同源性分析。
　　結(jié)果：183例MHD患者中,抗-HCV陽性13例,抗-HCV陽性率為7.1％。HCV-RNA定量≥1×103IU/mL者9例中,1b型7例,6a型2例。1b型中,PC1與PC2間的遺傳距離為0.000,PBC17與PC2間的遺傳距離為0.008,PC29與PBC31間的遺傳距離

3、為0.035,PC32與PBC34間的遺傳距離為0.102;6a型中,PC11與PC20間的遺傳距離為0.068。PC1與PC2的同源性為100%,PC2與PBC17的同源性為99.23%,PC29與PBC31同源性為96.63%,PC32與PBC34的同源性為90.64%,PC11與PC20同源性為93.63%。9例患者的平均感染時間為(67.4±26.3)月,平均透析時間為(81.5±38.1)月,4例(PC2、PC11、PC29和

4、PBC31)為輸入性HCV感染者,另5例(PC1、PBC17、PC20、PC32和PC34)是在本中心接受MHD后的8～77月間發(fā)現(xiàn)HCV感染。在本中心感染的5例患者中,2例(PC32和PC34)有輸血史及更換透析單位,3例(PC1、PBC17、PC20)無輸血、更換透析單位、腎移植等感染HCV危險因素,根據(jù)流行病學(xué)調(diào)查,具有同源性的病例PC1和PBC17與感染源(輸入性感染者)PC2患者有多次同班或鄰班、相鄰機(jī)位、同一護(hù)士操作的血透記

5、錄。
　　結(jié)論：深圳市第二人民醫(yī)院血液透析中心的抗-HCV陽性率為7.1%。1b型為深圳市第二人民醫(yī)院血液透析中心HCV感染的最常見基因型,其次為6a型。其中3例1b型患者(樣本PC1、PC2和PBC17)HCV感染為同一流行株,同源性達(dá)99%以上,結(jié)合流行病學(xué)資料確定1例患者(PC2)為輸入性傳染源,與之同源感染的PC1和PBC17患者的可能傳播途徑為,因當(dāng)時未對HCV陽性和陰性患者分區(qū)治療、同一護(hù)士同時操作HCV陽性和陰性患者