阿爾巴斯絨山羊毛囊干細(xì)胞的分離鑒定及轉(zhuǎn)錄因子Sox9對(duì)其作用機(jī)理的研究.pdf_第1頁(yè)
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1、毛囊是一個(gè)動(dòng)態(tài)的微小器官。它不僅具有預(yù)防皮膚組織受損、感覺和免疫防護(hù)等重要功能,且獲取方便。毛囊組織中含有與自我更新、分化、調(diào)控毛發(fā)生長(zhǎng)相關(guān)的多種干細(xì)胞,維持著皮膚的體內(nèi)平衡。而毛囊的發(fā)生和再生都離不開毛囊干細(xì)胞。毛囊干細(xì)胞的生物學(xué)研究日漸成為毛囊領(lǐng)域、皮膚學(xué)領(lǐng)域、再生醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的前沿。
  轉(zhuǎn)錄因子Sox9,在胚胎發(fā)育、三胚層分化、胚胎干細(xì)胞和多種成體干細(xì)胞的維持、先天性疾病等重要的生物學(xué)過(guò)程中具有重要的功能。近幾年發(fā)現(xiàn),在早期胚

2、胎生發(fā)板形成和毛囊發(fā)生中,Sox9有著至關(guān)重要的作用。
  目前,國(guó)際上對(duì)小鼠和人的毛囊干細(xì)胞研究較多,對(duì)家畜動(dòng)物毛囊干細(xì)胞的研究甚少。在本研究中,我們首次在體外分離鑒定了阿爾巴斯絨山羊毛囊干細(xì)胞(gHFSCs),并對(duì)其進(jìn)行了多能性分析;初步驗(yàn)證了Sox9在gHFSCs中的功能;并且進(jìn)行了Sox9染色質(zhì)共沉淀(ChIP),以期研究其在gHFSCs中的作用機(jī)制,為今后絨山羊毛囊生長(zhǎng)及其調(diào)控機(jī)理的研究提供實(shí)驗(yàn)材料和依據(jù)。
  一

3、、阿爾巴斯絨山羊毛囊干細(xì)胞(gHFSCs)的體外分離培養(yǎng)及鑒定
  我們利用組織貼壁培養(yǎng)法在體外分離gHFSCs,對(duì)其進(jìn)行純化。從細(xì)胞形態(tài)、特異標(biāo)記、增殖能力、體外分化能力等方面對(duì)其進(jìn)行了鑒定。結(jié)果顯示:實(shí)驗(yàn)所得到的細(xì)胞較小,呈典型的鵝卵石樣,折光度高且貼附能力強(qiáng),符合毛囊干細(xì)胞的形態(tài)特征,且在體外培養(yǎng)至20代未出現(xiàn)明顯形態(tài)變化。免疫組化染色顯示,gHFSCs陽(yáng)性表達(dá)毛囊干細(xì)胞標(biāo)記分子Krt15、Krt19、CD34、Itgβ1和

4、Krt14。CD34在gHFSCs中FACS(fluorescence-activated cell sorting)陽(yáng)性率為99.8%。從細(xì)胞生長(zhǎng)曲線可以看出,分離得到的gHFSCs具有較強(qiáng)的增殖能力。在轉(zhuǎn)錄水平上Krt14和CD34高表達(dá)(p<0.01),分別為絨山羊角質(zhì)細(xì)胞的39.68倍和24.37倍,Krt15的表達(dá)量為5.62倍,Itgβ1表達(dá)量低(p<0.01),為1.81倍。同樣Western blot檢測(cè)到了以上特異標(biāo)記

5、蛋白在gHFSCs中表達(dá)。體外成骨誘導(dǎo)后,Von Kossa法染色呈陽(yáng)性;成軟骨誘導(dǎo)阿爾新藍(lán)染色為陽(yáng)性;成肌誘導(dǎo)后Hoechst33342染色觀察到細(xì)胞融合現(xiàn)象,免疫組化染色檢測(cè)到成績(jī)誘導(dǎo)細(xì)胞MyoG表達(dá)呈陽(yáng)性。
  二、阿爾巴斯絨山羊毛囊干細(xì)胞(gHFSCs)的多能性分析
  我們對(duì)gHFSCs中與干細(xì)胞多能性建立和維持及自我更新能力相關(guān)的幾個(gè)因子Oct4、Nanog、 Sox2、AKP和TERT等,通過(guò)細(xì)胞免疫組化、FA

6、CS、Q-PCR和Western blot的方法進(jìn)行了的檢測(cè)。結(jié)果表明:細(xì)胞免疫組化染色顯示Oct4、Nanog、Sox2、AKP和TERT等五個(gè)因子均在gHFSCs中陽(yáng)性表達(dá);Oct4、Nanog和Sox2在gHFSCs中FACS陽(yáng)性率在99.9%以上;與阿爾巴斯絨山羊脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞(gADSCs)對(duì)比,在轉(zhuǎn)錄水平上,gHFSCs中Oct4高表達(dá),為對(duì)照細(xì)胞的41.36倍;Nanog、AKP、TERT中等表達(dá),分別為對(duì)照組的5.61

7、倍、2.74倍和2.10倍(p<0.01);在蛋白水平,Oct4、Nanog、AKP和TERT的相對(duì)表達(dá)量,分別為對(duì)照組的5.94倍、10.78倍、1.33倍和1.39倍。Sox2在gHFSCs中mRNA和蛋白水平均表達(dá),而在gADSCs中均不表達(dá)。
  三、Sox9在阿爾巴斯絨山羊毛囊干細(xì)胞(gHFSCs)中的功能驗(yàn)證
  通過(guò)毛囊(gHF)冰凍切片和細(xì)胞免疫組化、Q-PCR、Western blot檢測(cè)Sox9在gHF和

8、gHFSCs中的表達(dá);利用shRNA載體,干擾gHFSCs中Sox9的表達(dá),對(duì)與細(xì)胞增殖分化相關(guān)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平表達(dá)變化的檢測(cè);對(duì)gHFSCs特異標(biāo)記和干細(xì)胞多能因子在轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平的表達(dá)變化進(jìn)行檢測(cè);鈣誘導(dǎo)培養(yǎng)后,對(duì)gHFSCs中Sox9和Loricrin(Lor)的表達(dá)變化進(jìn)行檢測(cè)。
  結(jié)果顯示:Sox9在gHF整個(gè)外根鞘部位都有表達(dá),在隆突部表達(dá)比其他部位強(qiáng),在毛母質(zhì)中也有少量表達(dá),既Sox9主要在隆突部集中

9、表達(dá);在體外培養(yǎng)的gHFSCs呈Sox9陽(yáng)性,在細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核內(nèi)都有不同程度的表達(dá);Q-PCR和Western blot進(jìn)一步驗(yàn)證了Sox9在gHFSCs中的轉(zhuǎn)錄水平和蛋白水平的表達(dá)。
  Sox9-shRNA的干擾效率達(dá)到了53.58%。干擾Sox9表達(dá)之后:細(xì)胞增殖緩慢,無(wú)法進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,隨著生長(zhǎng)周期,凋亡細(xì)胞增多;流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)細(xì)胞周期發(fā)現(xiàn),干擾Sox9表達(dá)后的gHFSCs無(wú)法完成從S期到G2/M期的過(guò)渡;Q-PCR檢測(cè)與

10、對(duì)照組相比發(fā)現(xiàn),p21和細(xì)胞核抗原PCNA的表達(dá)量顯著減少(p<0.01),p53表達(dá)無(wú)顯著差異(p>0.05),皮膚細(xì)胞終末分化標(biāo)記Lor表達(dá)量顯著增加(p<0.01);gHFSCs不僅失去了毛囊干細(xì)胞形態(tài)特征,其特異標(biāo)記Krt15、Krt19、Krt14、CD34和Itgβ1在mRNA水平和蛋白水平的表達(dá)量均大幅降低(p<0.01);與干細(xì)胞多能性和自我更新能力相關(guān)的因子Oct4、Nanog、Sox2、AKP和TERT的表達(dá)量在轉(zhuǎn)錄

11、水平和蛋白水平表達(dá)量均急劇減少(p<0.01);低鈣培養(yǎng)的細(xì)胞形態(tài)無(wú)明顯變化,而高鈣誘導(dǎo)培養(yǎng)的細(xì)胞出現(xiàn)形態(tài)變化,呈長(zhǎng)梭形。Western blot蛋白條帶可以看出,高鈣誘導(dǎo)分化后的細(xì)胞中Sox9表達(dá)量減少,而低鈣和正常培養(yǎng)的細(xì)胞中無(wú)明顯變化;高鈣誘導(dǎo)分化后的細(xì)胞中Lor表達(dá)量增多,在低鈣和正常培養(yǎng)的細(xì)胞中表達(dá)量很少。
  四、ChIP結(jié)合ChIP-seq尋找Sox9結(jié)合的基因
  ChIP是目前研究體內(nèi)蛋白與DNA相互作用的

12、唯一手段。我們?cè)谇叭聝?nèi)容的基礎(chǔ)上,對(duì)gHFSCs進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子Sox9-ChIP得到蛋白-DNA復(fù)合物,利用ChIP-seq進(jìn)行測(cè)序,獲得與Sox9互作的基因信息。
  結(jié)果顯示:對(duì)超聲破碎效果良好的蛋白-DNA復(fù)合物進(jìn)行純化測(cè)序,ChIP-seq測(cè)序后得到了共10736個(gè)MACS-peaks和峰的位置信息。其中位于外顯子區(qū)(exonic)的有2008個(gè),內(nèi)含子(intronic)區(qū)有2827個(gè),基因間(intergenic)區(qū)有

13、5433個(gè),下游(downstream)區(qū)域有48個(gè),上游(upstream)區(qū)域有61個(gè),3'端非翻譯區(qū)(UTR3)有292個(gè),端非翻譯區(qū)(UTR5)有28個(gè),剪接(splicing)區(qū)有39個(gè);利用de novo finding找到了36個(gè)未知的motif信息,通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子motif數(shù)據(jù)和GO數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)得出96個(gè)已知的motif。Top motifs中排列第一的基序與Sox9 invitro motif匹配。已知motif比對(duì)中包括

14、明確的胚胎發(fā)育相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子Nanog、Oct4、Sox2、Tcf;對(duì)測(cè)序得到的所有基因進(jìn)行KEGG-pathway分析,跟據(jù)GO和KEGG中已有的信息共得到278條通路。其中p值小于0.05(p<0.05)的通路有FoxO信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路、cAMP信號(hào)通路、干細(xì)胞多能性調(diào)控通路和細(xì)胞骨架肌動(dòng)蛋白調(diào)控通路等24條通路;p值小于0.01(p<0.01)的通路有黏著斑(Focal adhesion)、粘著連接(Adherens ju

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