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文檔簡(jiǎn)介
1、NAC轉(zhuǎn)錄因子(NAC transcription factors)是高等陸生植物中所特有的一類(lèi)具有多種生物學(xué)功能的龐大的轉(zhuǎn)錄因子家族,它們參與植物的生長(zhǎng)發(fā)育、激素應(yīng)答、逆境脅迫等多種生物學(xué)反應(yīng)過(guò)程。近年來(lái),許多植物中的NAC基因被挖掘和克隆出來(lái),但苜蓿屬NAC基因的研究報(bào)道卻很少。本文以黃花苜蓿(Medicago falcata L.)為研究材料,進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析其數(shù)據(jù)并篩選出NAC轉(zhuǎn)錄因子,隨機(jī)選取10條黃花苜蓿NAC基因序列構(gòu)
2、建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)、進(jìn)行生物信息學(xué)分析并研究其結(jié)構(gòu)特點(diǎn),主要結(jié)果如下:
1)將10條黃花苜蓿NAC蛋白與TFDB中收錄的85條截形苜蓿NAC蛋白進(jìn)行多序列比對(duì)與系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建,結(jié)果顯示,這95條苜蓿屬NAC轉(zhuǎn)錄因子共分為Ⅰ~Ⅴ的5個(gè)大類(lèi),黃花苜蓿NAC轉(zhuǎn)錄因子與截形苜蓿NAC轉(zhuǎn)錄因子具有較高的同源性。
2)分析10種黃花苜蓿NAC蛋白氨基酸序列的一級(jí)結(jié)構(gòu)及理化性質(zhì),二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)、模序預(yù)測(cè)和蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)
3、測(cè)。預(yù)測(cè)結(jié)果顯示10種黃花苜蓿NAC蛋白二級(jí)與三級(jí)結(jié)構(gòu)具有較高的相似性且保守結(jié)構(gòu)域均為NAM結(jié)構(gòu)域,也驗(yàn)證了其符合NAC轉(zhuǎn)錄因子家族的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),即蛋白質(zhì)的N端為高度保守的DNA結(jié)構(gòu)域與C端呈現(xiàn)多樣化的轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)域。
3)從黃花苜蓿中克隆出c78782_g3基因的cDNA,長(zhǎng)度為911bp,共編碼292個(gè)氨基酸殘基的親水蛋白。
以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果,對(duì)黃花苜蓿NAC轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育與抗逆機(jī)制的進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究提供了科學(xué)
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