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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
探討胃癌中miR-181a靶位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性(SNP)對(duì)胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響,并且探索其可能的分子機(jī)制。
方法:
1.運(yùn)用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)miR-181a所有靶基因的3’非翻譯區(qū)(3’UTR)的SNP位點(diǎn),選取位于miR-181a靶位點(diǎn)的SNP,并通過(guò)病例-對(duì)照研究(包括500例胃癌患者和502例正常對(duì)照者),采用PCR-RFLP方法檢測(cè)所選取的SNP與胃癌易感性和預(yù)后的關(guān)系。
2.在5
2、0對(duì)人胃癌和癌旁非癌組織和50例正常人胃粘膜組織進(jìn)行SNP基因分型,檢測(cè)miR-181a和SNP對(duì)于基因的表達(dá)情況及其與基因型的關(guān)系。
3.構(gòu)建不同基因型的表達(dá)載體,采用雙熒光素酶驗(yàn)證miRNA與該基因的關(guān)系,并檢測(cè)6株胃癌細(xì)胞株和正常胃粘膜細(xì)胞株GES-1中miRNA和該基因的表達(dá)情況,選取一株細(xì)胞進(jìn)行miRNA過(guò)表達(dá)和抑制研究,探討miR-181a對(duì)靶基因表達(dá)的調(diào)控。
結(jié)果:
1.通過(guò)生物信息學(xué)預(yù)測(cè)mi
3、R-181a靶位點(diǎn)SNP,選取其中的rs12537(MTMR3),rs1460008(EREG)和rs10954213(IRF5)三個(gè)SNP位點(diǎn),通過(guò)病例-對(duì)照研究,發(fā)現(xiàn)rs12537與胃癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),其余兩個(gè)SNPs與胃癌無(wú)關(guān);rs12537的CT+TT基因型顯著增加胃癌易感性(adjustedOR=1.89,95%CI:1.45-2.46,P<0.01),并縮短總生存期(HR=1.8,95%CI:1.03-1.83,P=0.02
4、9)。
2.50例胃癌組織中MTMR3和癌旁非癌組織無(wú)顯著差異(P=0.071),但兩者明顯低于正常胃粘膜組織(P<0.001);而miR-181a表達(dá)則在三組織中依次遞增(P<0.001);CT基因型的胃癌組織中MTMR3表達(dá)明顯低于CC基因型(P=0.013),而兩組間miR-181a無(wú)顯著差異(P=0.135)。
3.生物信息學(xué)預(yù)測(cè)T等位基因增加了miR-181a靶位點(diǎn),可能導(dǎo)致miR-181a對(duì)MTMR3抑制
5、增強(qiáng)。雙熒光素酶進(jìn)行靶基因驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),過(guò)表達(dá)miR-181a能顯著抑制MTMR33’UTR的熒光活性,且對(duì)包含rs12537T等位基因的質(zhì)粒的表達(dá)抑制強(qiáng)于C等位基因,但無(wú)顯著差異(P=0.055)。細(xì)胞學(xué)分析發(fā)現(xiàn)過(guò)表達(dá)miR-181a能抑制SGC-7901細(xì)胞中MTMR3的蛋白的表達(dá)。
結(jié)論:
1.本研究首次報(bào)道了rs12537與胃癌的易感性和預(yù)后有關(guān);
2.miR-181a及其直接靶基因MTMR3在胃癌中扮
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